RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC50Q8IVM0 306 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 JOSD2Q8TAC2 188 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MIS12Q9H081 205 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LRRC19Q9H756 370 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ST7Q9NRC1 585 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DAPK3O43293 454 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PFKMP08237 780 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GJC1P36383 396 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LIMS2Q7Z4I7 341 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RAET1EQ8TD07 263 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZFP42Q96MM3 310 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ERP44Q9BS26 406 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HTTP42858 3142 aa27.91■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 H3BQF6 201 aa27.9■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PSMA2P25787 234 aa27.9■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ITGA7Q13683 1181 aa27.9■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LLGL1Q15334 1064 aa27.9■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PKDCCQ504Y2 493 aa27.9■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PXYLP1Q8TE99 480 aa27.9■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A8MXQ7 604 aa27.89■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SETSIPP0DME0 302 aa27.89■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TCF4P15884 667 aa27.89■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PTK7Q13308 1070 aa27.89■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ARHGAP17Q68EM7 881 aa27.89■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DUPD1Q68J44 220 aa27.89■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MREGQ8N565 214 aa27.89■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 APPL2Q8NEU8 664 aa27.89■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HERPUD2Q9BSE4 406 aa27.89■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM49BQ9NUQ9 324 aa27.89■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC38A7Q9NVC3 462 aa27.89■■■□□ 2.06
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MEIS3P2A8K0S8 358 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GNRH1P01148 92 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RALAP11233 206 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LILRA4P59901 499 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TTC30AQ86WT1 665 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RCOR2Q8IZ40 523 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CRYBG2Q8N1P7 616 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DPH5Q9H2P9 285 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRIM17Q9Y577 477 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PODXLO00592 558 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CETN2P41208 172 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ACLYP53396 1101 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC105Q8IYK2 499 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OSBPL8Q9BZF1 889 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DPEP3Q9H4B8 488 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MED4Q9NPJ6 270 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HESX1Q9UBX0 185 aa27.88■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HUS1O60921 280 aa27.87■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FGFR1P11362 822 aa27.87■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MLH1P40692 756 aa27.87■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GSTCDQ8NEC7 633 aa27.87■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DNAI2Q9GZS0 605 aa27.87■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NEUROG2Q9H2A3 272 aa27.87■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SNX25Q9H3E2 840 aa27.87■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PADI3Q9ULW8 664 aa27.87■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NOD1Q9Y239 953 aa27.87■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 E5RJQ4 531 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CD52P31358 61 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DRG2P55039 364 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HSP90B2PQ58FF3 399 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 POLNQ7Z5Q5 900 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TOP6BLQ8N6T0 577 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EMC1Q8N766 993 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLCO2A1Q92959 643 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GAD1Q99259 594 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OSBPL7Q9BZF2 842 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GIT1Q9Y2X7 761 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CENPFP49454 3210 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GOLGA6BA6NDN3 693 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KRT1P04264 644 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GHRP10912 638 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM26DQ5JW98 314 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF618Q5T7W0 954 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ADGRF2Q8IZF7 708 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC35F5Q8WV83 523 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C1orf54Q8WWF1 131 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLITRK1Q96PX8 696 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRAIPQ9BWF2 469 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HEMGNQ9BXL5 484 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRIM31Q9BZY9 425 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KLHL11Q9NVR0 708 aa27.86■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HCRTO43612 131 aa27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms