RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	ZBTB5	O15062	677 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	FOXP2	O15409	715 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	CREB3	O43889	395 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	B4GALT3	O60512	393 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	OFD1	O75665	1012 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	ALDH2	P05091	517 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	PGR	P06401	933 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	ITGAV	P06756	1048 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	SPATA31D3	P0C874	917 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	STAT5B	P51692	787 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	CREB5	Q02930	508 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	LMAN2	Q12907	356 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	SEMA3B	Q13214	749 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	MTMR1	Q13613	665 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	DHCR24	Q15392	516 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	ELF2	Q15723	593 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	RTL10	Q7L3V2	364 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	PALB2	Q86YC2	1186 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	TTC8	Q8TAM2	541 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	MDM1	Q8TC05	714 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	CORO1B	Q9BR76	489 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	BRD9	Q9H8M2	597 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	MARCH5	Q9NX47	278 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	ZMYM6	O95789	1325 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	NRP1	O14786	923 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	GPR39	O43194	453 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	PRODH	O43272	600 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF623	O75123	536 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	KRT38	O76015	456 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	DDHD2	O94830	711 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	C22orf31	O95567	290 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	EPHX1	P07099	455 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	CTSB	P07858	339 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	MYB	P10242	640 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	PSMC3	P17980	439 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	LIG1	P18858	919 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	FCAR	P24071	287 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	CCNE1	P24864	410 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	MAOB	P27338	520 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	NTHL1	P78549	312 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	CFHR1	Q03591	330 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	STRN3	Q13033	797 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	LIN9	Q5TKA1	542 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234		Q6ZS52	159 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	C12orf40	Q86WS4	652 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	URGCP	Q8TCY9	931 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	MDFI	Q99750	246 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	CDH19	Q9H159	772 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	PRORY	Q9H606	182 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	TOMM22	Q9NS69	142 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	NFASC	O94856	1347 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	ARNTL	O00327	626 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	RGS13	O14921	159 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	WISP1	O95388	367 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	VTN	P04004	478 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	C8A	P07357	584 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TRIM25-208	ENST00000574234	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49

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