RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574095.1

NPLOC4-215, Transcript of NPL4 homolog, ubiquitin recognition factor, human

TSL 3

Gene NPLOC4, Length 277 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPLOC4-215	ENST00000574095	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		27.87	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		27.87	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	NME7	Q9Y5B8	376 aa		27.87	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	ARNTL	O00327	626 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	CHAD	O15335	359 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	NR3C1	P04150	777 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	TNNC1	P63316	161 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	MYLPF	Q96A32	169 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	SNX25	Q9H3E2	840 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	MAN2B1	O00754	1011 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	TACC1	O75410	805 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	RHOBTB3	O94955	611 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	WEE1	P30291	646 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	BIRC3	Q13489	604 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	OBP2A	Q9NY56	170 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		27.85	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	NCAM2	O15394	837 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	NOL4	O94818	638 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	BDNF	P23560	247 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	ATIC	P31939	592 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	DLG4	P78352	724 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	CYP27A1	Q02318	531 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	FZD5	Q13467	585 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	CEP135	Q66GS9	1140 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	TXNDC8	Q6A555	127 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	FAM3C	Q92520	227 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	CLDN23	Q96B33	292 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		27.84	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	DMD	P11532	3685 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	MAGEA11	P43364	429 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	AP3M2	P53677	418 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	CLDN10	P78369	228 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	TTC8	Q8TAM2	541 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	PATJ	Q8NI35	1801 aa		27.83	■■■□□ 2.05
NPLOC4-215	ENST00000574095	PTPRD	P23468	1912 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	CLSTN1	O94985	981 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	KIF20A	O95235	890 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	FAM163B	P0C2L3	166 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	SP9	P0CG40	484 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	CCNE1	P24864	410 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	PCED1B	Q96HM7	432 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	MYRFL	Q96LU7	910 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		27.82	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	TADA3	O75528	432 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	VNN1	O95497	513 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	27.81	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	AVPR1A	P37288	418 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	GRIK1	P39086	918 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	MAGEA9	P43362	315 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	SOX9	P48436	509 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	CDH8	P55286	799 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	NUCB2	P80303	420 aa		27.81	■■■□□ 2.04
NPLOC4-215	ENST00000574095	NCOA4	Q13772	614 aa		27.81	■■■□□ 2.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms