RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 IFT20Q8IY31 132 aa30.73■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM86AQ8N2M4 240 aa30.73■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 ST7Q9NRC1 585 aa30.73■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 MTUS1Q9ULD2 1270 aa30.73■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAD51CO43502 376 aa30.72■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAX3P23760 479 aa30.72■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 LMO2P25791 158 aa30.72■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa30.72■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC38Q5VT99 294 aa30.72■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAATS1Q7Z4T9 603 aa30.72■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 KATNAL2Q8IYT4 538 aa30.72■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 SENP8Q96LD8 212 aa30.72■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZMYND10O75800 440 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 EOMESO95936 686 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAS2R40P59535 323 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 OGDHQ02218 1023 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 BFSP2Q13515 415 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 MBTPS1Q14703 1052 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD52Q8NB46 1076 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC35F5Q8WV83 523 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAIP1Q8WWC4 291 aa30.71■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 GABRDO14764 452 aa30.7■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 INPPL1O15357 1258 aa30.7■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 SELPP16109 830 aa30.7■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 SSR1P43307 286 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 UPP1Q16831 310 aa30.7■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC8DQ7L1W4 858 aa30.7■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 OSTM1Q86WC4 334 aa30.7■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 UROC1Q96N76 676 aa30.7■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 FTHL17Q9BXU8 183 aa30.7■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC4A5Q9BY07 1137 aa30.7■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 GDF3Q9NR23 364 aa30.7■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP30.7■■■□□ 2.51
CTDNEP1-208ENST00000573600 BCAT1P54687 386 aa30.7■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 BST2Q10589 180 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC24A5Q71RS6 500 aa30.7■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 C9IYK1 514 aa30.69■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 PSMA2P25787 234 aa30.69■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 LHX1P48742 406 aa30.69■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACAP1Q15027 740 aa30.69■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 WSCD1Q658N2 575 aa30.69■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 DSTYKQ6XUX3 929 aa30.69■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM110Q86TL2 294 aa30.69■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM126BQ8IXS8 530 aa30.69■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa30.69■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 EXD1Q8NHP7 514 aa30.69■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 JOSD2Q8TAC2 188 aa30.69■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYLDQ9NQC7 956 aa30.69■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 CASTOR2A6NHX0 329 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 E5RJQ4 531 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 FSCN2O14926 492 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 HCRTO43612 131 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 PHF2O75151 1096 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 POMCP01189 267 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 GLI1P08151 1106 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 CETN2P41208 172 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 TUSC3Q13454 348 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR6B2Q6IFH4 312 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 PMF1Q6P1K2 205 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 DEFB118Q96PH6 123 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 OGDHLQ9ULD0 1010 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 NR2E1Q9Y466 385 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCNTO95613 3336 aa30.68■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 F8VP50 259 aa30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHRNA3P32297 505 aa30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 GUCY2DQ02846 1103 aa30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 PDE4CQ08493 712 aa30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPATA18Q8TC71 538 aa30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 RUNDC3BQ96NL0 473 aa30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 EPB41L5Q9HCM4 733 aa30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC130P13994 396 aa30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM189BP81408 668 aa30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 CACNG4Q9UBN1 327 aa30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 AMACRQ9UHK6 382 aa30.67■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADORA2BP29275 332 aa30.66■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 CYP1B1Q16678 543 aa30.66■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 HDXQ7Z353 690 aa30.66■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 RCOR2Q8IZ40 523 aa30.66■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 LPIN3Q9BQK8 851 aa30.66■■■□□ 2.5
CTDNEP1-208ENST00000573600 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms