RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 GPR15P49685 360 aa22.48■■□□□ 1.19
SNAP23-216ENST00000568331 CDH8P55286 799 aa22.48■■□□□ 1.19
SNAP23-216ENST00000568331 GPC5P78333 572 aa22.48■■□□□ 1.19
SNAP23-216ENST00000568331 PPP3CAQ08209 521 aa22.48■■□□□ 1.19
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC142Q17RM4 750 aa22.48■■□□□ 1.19
SNAP23-216ENST00000568331 GAREM2Q75VX8 874 aa22.48■■□□□ 1.19
SNAP23-216ENST00000568331 FLCNQ8NFG4 579 aa22.48■■□□□ 1.19
SNAP23-216ENST00000568331 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.48■■□□□ 1.19
SNAP23-216ENST00000568331 PTPRDP23468 1912 aa22.48■■□□□ 1.19
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SNAP23-216ENST00000568331 ANXA13P27216 316 aa22.47■■□□□ 1.19
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SNAP23-216ENST00000568331 E2F7Q96AV8 911 aa22.47■■□□□ 1.19
SNAP23-216ENST00000568331 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.47■■□□□ 1.19
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SNAP23-216ENST00000568331 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.46■■□□□ 1.19
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SNAP23-216ENST00000568331 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.193e-7■■■■□ 21.9
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SNAP23-216ENST00000568331 CYP4F8P98187 520 aa22.45■■□□□ 1.18
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SNAP23-216ENST00000568331 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.45■■□□□ 1.18
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SNAP23-216ENST00000568331 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
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SNAP23-216ENST00000568331 ATP8B3O60423 1300 aa22.45■■□□□ 1.18
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SNAP23-216ENST00000568331 DPYSL4O14531 572 aa22.44■■□□□ 1.18
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SNAP23-216ENST00000568331 YAF2Q8IY57 180 aa22.44■■□□□ 1.18
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SNAP23-216ENST00000568331 MED10Q9BTT4 135 aa22.44■■□□□ 1.18
SNAP23-216ENST00000568331 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.44■■□□□ 1.18
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SNAP23-216ENST00000568331 SDCBP2Q9H190 292 aa22.44■■□□□ 1.18
SNAP23-216ENST00000568331 BRD9Q9H8M2 597 aa22.44■■□□□ 1.18
SNAP23-216ENST00000568331 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.44■■□□□ 1.18
SNAP23-216ENST00000568331 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.44■■□□□ 1.18
SNAP23-216ENST00000568331 KRBA1A5PL33 1030 aa22.43■■□□□ 1.18
SNAP23-216ENST00000568331 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.43■■□□□ 1.18
SNAP23-216ENST00000568331 F11P03951 625 aa22.43■■□□□ 1.18
SNAP23-216ENST00000568331 PSMC3P17980 439 aa22.43■■□□□ 1.18
SNAP23-216ENST00000568331 BMP6P22004 513 aa22.43■■□□□ 1.18
SNAP23-216ENST00000568331 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
SNAP23-216ENST00000568331 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SNAP23-216ENST00000568331 GRM2Q14416 872 aa22.43■■□□□ 1.18
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