RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ALAD	P13716	330 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	TSHR	P16473	764 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	CA4	P22748	312 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	KCNJ2	P63252	427 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ASRGL1	Q7L266	308 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	SYNC	Q9H7C4	482 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		19.34	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		19.33	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ZWINT	O95229	277 aa		19.33	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	KDELR1	P24390	212 aa		19.33	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	19.33	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	MYO1E	Q12965	1108 aa		19.33	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		19.33	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		19.33	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	HHAT	Q5VTY9	493 aa		19.33	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		19.33	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		19.33	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	ZWILCH	Q9H900	591 aa		19.33	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		19.33	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	MCM8	Q9UJA3	840 aa		19.33	■□□□□ 0.69
RRN3-205	ENST00000563559	TYROBP	O43914	113 aa		19.33	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	LGR5	O75473	907 aa		19.33	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	UNC5C	O95185	931 aa		19.33	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	PDE4C	Q08493	712 aa		19.33	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC3	Q13217	504 aa		19.33	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	19.33	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	19.33	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	19.33	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	BCO2	Q9BYV7	579 aa		19.33	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	FZD8	Q9H461	694 aa		19.33	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	19.33	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	19.33	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	19.32	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	DCTN3	O75935	186 aa		19.32	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	19.32	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	19.32	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	BAG6	P46379	1132 aa		19.32	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	DYNLT1	P63172	113 aa		19.32	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	MGAT5	Q09328	741 aa		19.32	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		19.32	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	WDR78	Q5VTH9	848 aa		19.32	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		19.32	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	CPT1B	Q92523	772 aa		19.32	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		19.32	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	PNMA3	Q9UL41	463 aa		19.32	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559		E7ESA3	106 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	RNF8	O76064	485 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	APOC2	P02655	101 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	SLC26A2	P50443	739 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	E2F5	Q15329	346 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	PDIK1L	Q8N165	341 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD6	Q8NC69	237 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	GPR20	Q99678	358 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	BTBD7	Q9P203	1132 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	IL1R2	P27930	398 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	GPX6	P59796	221 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	MOGS	Q13724	837 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	LY6K	Q17RY6	165 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	XYLT1	Q86Y38	959 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	GGA3	Q9NZ52	723 aa		19.31	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	MCF2L	O15068	1137 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	KRT19	P08727	400 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	CCND1	P24385	295 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	MARK3	P27448	753 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	MSH2	P43246	934 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	RAD23B	P54727	409 aa		19.3	■□□□□ 0.68
RRN3-205	ENST00000563559	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	19.3	■□□□□ 0.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms