RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CHST13	Q8NET6	341 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	RREB1	Q92766	1687 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431		A0A088AWK7	358 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431		A6NNZ2	444 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CLGN	O14967	610 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PJA2	O43164	708 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	FZD7	O75084	574 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	AMH	P03971	560 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	MGAT1	P26572	445 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PEX2	P28328	305 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PHKA1	P46020	1223 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	NOMO3	P69849	1222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CRHR2	Q13324	411 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PDILT	Q8N807	584 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	F2RL2	O00254	374 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	APAF1	O14727	1248 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	FYB1	O15117	783 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CYP27B1	O15528	508 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	TIMM44	O43615	452 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	FOXS1	O43638	330 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	GNAI2	P04899	355 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	MYL3	P08590	195 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	KIT	P10721	976 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	COMT	P21964	271 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PRDX5	P30044	214 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC7A1	P30825	629 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	MED25	Q71SY5	747 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	DOK3	Q7L591	496 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.8	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	RTL1	A6NKG5	1358 aa		4.79	□□□□□ -1.64
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC7	Q96M83	1385 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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