RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560297.5

USP8-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 8, human

TSL 5

Gene USP8, Length 652 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP8-209	ENST00000560297	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP8-209	ENST00000560297	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP8-209	ENST00000560297	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP8-209	ENST00000560297	GPR88	Q9GZN0	384 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP8-209	ENST00000560297	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP8-209	ENST00000560297	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP8-209	ENST00000560297	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP8-209	ENST00000560297	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
USP8-209	ENST00000560297	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP8-209	ENST00000560297	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
USP8-209	ENST00000560297	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP8-209	ENST00000560297	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
USP8-209	ENST00000560297	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP8-209	ENST00000560297	CYP26A1	O43174	497 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	MED7	O43513	233 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	EPCAM	P16422	314 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	ALDH1A3	P47895	512 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	SLC8A3	P57103	927 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	ORC1	Q13415	861 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	BAP1	Q92560	729 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	MYLPF	Q96A32	169 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	MED10	Q9BTT4	135 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	MYO7A	Q13402	2215 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	VWA8	A3KMH1	1905 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	ZMYND10	O75800	440 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	SEC24A	O95486	1093 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	VNN2	O95498	520 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	ADCY5	O95622	1261 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	FER	P16591	822 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	BDNF	P23560	247 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	CYP2F1	P24903	491 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	GNA15	P30679	374 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	HOXA9	P31269	272 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	CLCN1	P35523	988 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	ZBED6	P86452	979 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	PLD1	Q13393	1074 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	HESX1	Q9UBX0	185 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297		O00370	1275 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	CLDN5	O00501	218 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	TRIM66	O15016	1216 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	THAP12	O43422	761 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	GFPT2	O94808	682 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	LRG1	P02750	347 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	GYPC	P04921	128 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	C8A	P07357	584 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	FAM200B	P0CF97	657 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	CCDC130	P13994	396 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	CYP11B1	P15538	503 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	ADORA2B	P29275	332 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	CDC25B	P30305	580 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	KRT9	P35527	623 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	GRIK1	P39086	918 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	MRE11	P49959	708 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	EPHB3	P54753	998 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	GSE1	Q14687	1217 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	MEA1	Q16626	185 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	TMC6	Q7Z403	805 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	FAM35A	Q86V20	835 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	ZNF677	Q86XU0	584 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13	□□□□□ -0.33
USP8-209	ENST00000560297	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13	□□□□□ -0.33

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