RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	DPH1	Q9BZG8	443 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	ETAA1	Q9NY74	926 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	FNIP2	Q9P278	1114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	POM121B	A6NF01	834 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	UNC5C	O95185	931 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	IL18RAP	O95256	599 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	TH	P07101	528 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	TNFSF4	P23510	183 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	STT3A	P46977	705 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF844	Q08AG5	666 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	DAG1	Q14118	895 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	LONRF3	Q496Y0	759 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	USP37	Q86T82	979 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	OR2C3	Q8N628	320 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SIK2	Q9H0K1	926 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	COL20A1	Q9P218	1284 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876		F8W8V4	182 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876		M0QYG6	137 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	PROM1	O43490	865 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	DNAJB5	O75953	348 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	CHEK2	O96017	543 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	GRP	P07492	148 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SETSIP	P0DME0	302 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	CXCR5	P32302	372 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	BTK	Q06187	659 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	CTBP1	Q13363	440 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	DYRK1A	Q13627	763 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	RAB32	Q13637	225 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	FAM209B	Q5JX69	171 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	VWA1	Q6PCB0	445 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SKAP1	Q86WV1	359 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF575	Q86XF7	245 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	MAML1	Q92585	1016 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	INTS13	Q9NVM9	706 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	PADI4	Q9UM07	663 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	MYO1C	O00159	1063 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	TOR1B	O14657	336 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	NCK2	O43639	380 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	C1QL1	O75973	258 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SRGN	P10124	158 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	PPP3CB	P16298	524 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	TSHR	P16473	764 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	CHRM3	P20309	590 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SLC11A2	P49281	568 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	PIGF	Q07326	219 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	TCF15	Q12870	199 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	SMC5	Q8IY18	1101 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	MPP5	Q8N3R9	675 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RBM23-208	ENST00000553876	TRIB1	Q96RU8	372 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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