RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551549.1

GCN1-208, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, human

TSL 2

Gene GCN1, Length 258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCN1-208	ENST00000551549	TXNDC8	Q6A555	127 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	FAM171B	Q6P995	826 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	SPATA18	Q8TC71	538 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	ZNF516	Q92618	1163 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	FNBP1	Q96RU3	617 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	MMS19	Q96T76	1030 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CCL26	Q9Y258	94 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	TADA3	O75528	432 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CSH1	P0DML2	217 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CSH2	P0DML3	217 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CHRNB1	P11230	501 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	DPH6	Q7L8W6	267 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	MON1A	Q86VX9	555 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	RIN3	Q8TB24	985 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	MYLPF	Q96A32	169 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	SPATA32	Q96LK8	384 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	SYT15	Q9BQS2	421 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CHRD	Q9H2X0	955 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	EXOC1	Q9NV70	894 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	OBP2A	Q9NY56	170 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CDH9	Q9ULB4	789 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	HPSE	Q9Y251	543 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	NME7	Q9Y5B8	376 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	LAMA1	P25391	3075 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	EXOC3	O60645	756 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	BDNF	P23560	247 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	AVPR1A	P37288	418 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	NDUFA8	P51970	172 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	MYL6	P60660	151 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CYP27A1	Q02318	531 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	GAS6	Q14393	721 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	NELL1	Q92832	810 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	MYRFL	Q96LU7	910 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	SLC22A12	Q96S37	553 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	SNX25	Q9H3E2	840 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	GKN1	Q9NS71	199 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	TDP1	Q9NUW8	608 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	DMAC2	Q9NW81	257 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CACNA1A	O00555	2505 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	TACC1	O75410	805 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	PRR29	P0C7W0	189 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	TDGF1	P13385	188 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	ARSA	P15289	507 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CTH	P32929	405 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	MAGEA11	P43364	429 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	SYK	P43405	635 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	CACNA2D1	P54289	1103 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	USP46	P62068	366 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	TNNC1	P63316	161 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	KRT85	P78386	507 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GCN1-208	ENST00000551549	SATB1	Q01826	763 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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