RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549279.1

TPCN1-212, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 4

Gene TPCN1, Length 544 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-212ENST00000549279 GPC5P78333 572 aa21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 PFKPQ01813 784 aa21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 PPP3CAQ08209 521 aa21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 DDR2Q16832 855 aa21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 KRT39Q6A163 491 aa21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 SCN4BQ8IWT1 228 aa21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 E2F7Q96AV8 911 aa21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 PCED1BQ96HM7 432 aa21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 TNIP3Q96KP6 325 aa21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 TRPV4Q9HBA0 871 aa21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.5■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.49■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 RFX1P22670 979 aa21.49■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 FCARP24071 287 aa21.49■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 CDH8P55286 799 aa21.49■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 MORC3Q14149 939 aa21.49■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 GPR158Q5T848 1215 aa21.49■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.49■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.49■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 IL21Q9HBE4 155 aa21.49■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 CA14Q9ULX7 337 aa21.49■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 NME7Q9Y5B8 376 aa21.49■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 BICDL2A1A5D9 508 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 BIN1O00499 593 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 TRIM66O15016 1216 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 BDNFP23560 247 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 ANXA13P27216 316 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 AVPR2P30518 371 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 GRIK1P39086 918 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 RAP1GAPP47736 663 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 MXI1P50539 228 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 TCERG1LQ5VWI1 586 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 FLCNQ8NFG4 579 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 DPEP3Q9H4B8 488 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 TASP1Q9H6P5 420 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.48■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 KRBA1A5PL33 1030 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 NOL4O94818 638 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 PSMC3P17980 439 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 CLCN5P51795 746 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 NLRP12P59046 1061 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 CYP4F8P98187 520 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 SHDQ96IW2 340 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 SPATA17Q96L03 361 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 MYRFLQ96LU7 910 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 CEP63Q96MT8 703 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 PRRX2Q99811 253 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 SDCBP2Q9H190 292 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 ATP8B3O60423 1300 aa21.47■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 STK25O00506 426 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 DPYSL4O14531 572 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 F11P03951 625 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 BMP6P22004 513 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 ASPAP45381 313 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 VCPP55072 806 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 CAMK4Q16566 473 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 FOXR2Q6PJQ5 311 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 VITQ6UXI7 678 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 CLEC17AQ6ZS10 378 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 UNC93AQ86WB7 457 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 STKLD1Q8NE28 680 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 NELFBQ8WX92 580 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 BCO2Q9BYV7 579 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 BRD9Q9H8M2 597 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 EHD2Q9NZN4 543 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.46■■□□□ 1.03
TPCN1-212ENST00000549279 KMT2EQ8IZD2 1858 aa21.45■■□□□ 1.02
TPCN1-212ENST00000549279 SOBPA7XYQ1 873 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms