RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 PCED1BQ96HM7 432 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 ACBD6Q9BR61 282 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PACSIN1Q9BY11 444 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 CERS4Q9HA82 394 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 AAASQ9NRG9 546 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 MTRRQ9UBK8 725 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-216ENST00000549221 ARHGEF37A1IGU5 675 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 WDR27A2RRH5 827 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 M0QYV0 167 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ARHGAP6O43182 974 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 AKR1B10O60218 316 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 GABBR2O75899 941 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 BEST1O76090 585 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 LCA5LO95447 670 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ABL1P00519 1130 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CCDC172P0C7W6 258 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CTSAP10619 480 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TNFAIP3P21580 790 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 IRS1P35568 1242 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 BPIFB4P59827 614 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ERVFC1P60507 584 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ERVK-21P61565 698 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PTPN14Q15678 1187 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CNGA2Q16280 664 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PSMD5Q16401 504 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SLC18A3Q16572 532 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SLC39A12Q504Y0 691 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 C2CD6Q53TS8 623 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 NAA35Q5VZE5 725 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 FAM35AQ86V20 835 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 FMNL3Q8IVF7 1028 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 THEM5Q8N1Q8 247 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 POF1BQ8WVV4 589 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TNIP3Q96KP6 325 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CCDC42Q96M95 316 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PGLYRP2Q96PD5 576 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PLVAPQ9BX97 442 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 DEF6Q9H4E7 631 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 NAGPAQ9UK23 515 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 BACE2Q9Y5Z0 518 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PTPRDP23468 1912 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CDH23Q9H251 3354 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 MTMR11A4FU01 709 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 OR6C75A6NL08 312 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 USP27XA6NNY8 438 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 HIDE1A8MVS5 230 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 H7C4K7 107 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 RFXAPO00287 272 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 FSCN2O14926 492 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TEX28O15482 410 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 SOAT2O75908 522 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 URODP06132 367 aa8.63□□□□□ -1.03
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CS-216ENST00000549221 ANXA13P27216 316 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 OR1D2P34982 312 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 GPD2P43304 727 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 GPR15P49685 360 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ARPP19P56211 112 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 TSPY1Q01534 308 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 ROR1Q01973 937 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 CENPCQ03188 943 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PDE4CQ08493 712 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 PTP4A2Q12974 167 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-216ENST00000549221 RAB30Q15771 203 aa8.63□□□□□ -1.03
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