RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	IQGAP2	Q13576	1575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	SYT5	O00445	386 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM38	O00635	465 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	STC2	O76061	302 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	C1S	P09871	688 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	MYL4	P12829	197 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	ACRV1	P26436	265 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	GABRB3	P28472	473 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	SERPINF1	P36955	418 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	INHBE	P58166	350 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXO1	Q12778	655 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB32	Q13637	225 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	TAF5	Q15542	800 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	TBATA	Q96M53	351 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	NELL2	Q99435	816 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	PODXL	O00592	558 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	NCAM2	O15394	837 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	PYGL	P06737	847 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	GRP	P07492	148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	KLRC1	P26715	233 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	HSPA2	P54652	639 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	GRM1	Q13255	1194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	PRKG1	Q13976	671 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	RAB30	Q15771	203 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	GOLGA3	Q08378	1498 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308		E9PLN8	166 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	PJA2	O43164	708 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	HAUS5	O94927	633 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	A1BG	P04217	495 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	BDNF	P23560	247 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNHG1-222	ENST00000545308	INHBC	P55103	352 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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