RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 PDIK1LQ8N165 341 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 MARVELD2Q8N4S9 558 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 MZB1Q8WU39 189 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 DCAKDQ8WVC6 231 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 NLRP4Q96MN2 994 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 HEMGNQ9BXL5 484 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 NMUR2Q9GZQ4 415 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 EBF3Q9H4W6 596 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 MKS1Q9NXB0 559 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 HSPBP1Q9NZL4 362 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SLC7A8Q9UHI5 535 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SERPINB13Q9UIV8 391 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 EFR3BQ9Y2G0 817 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 WDR37Q9Y2I8 494 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 BRWD3Q6RI45 1802 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 FAM86B1E9PN63 330 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 COPEO14579 308 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 DENRO43583 198 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SLITRK3O94933 977 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TNFAIP8O95379 198 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CLPTM1O96005 669 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 INHBAP08476 426 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 FGFR1P11362 822 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 HARSP12081 509 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 BMP3P12645 472 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 IDO1P14902 403 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ADRA2BP18089 450 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ETV4P43268 484 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 WASHC5Q12768 1159 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 MTA1Q13330 715 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 POTEAQ6S8J7 498 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 OTOP1Q7RTM1 612 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 KRT27Q7Z3Y8 459 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 RDH13Q8NBN7 331 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 FBXL13Q8NEE6 735 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TRPC4APQ8TEL6 797 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 MKL1Q969V6 931 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SETDB2Q96T68 719 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ARHGEF4Q9NR80 690 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 RAB26Q9ULW5 256 aa11.33□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TAF1P21675 1872 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 GRIN3BO60391 1043 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 GAS7O60861 476 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 KRT37O76014 449 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 KRT5P13647 590 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 GLRA2P23416 452 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SLC16A2P36021 539 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ACADVLP49748 655 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 DLG4P78352 724 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TAP1Q03518 808 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 USP4Q13107 963 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CBLBQ13191 982 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SPIDRQ14159 915 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CPNE8Q86YQ8 564 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 AHI1Q8N157 1196 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 NUP93Q8N1F7 819 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 HELQQ8TDG4 1101 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CLMNQ96JQ2 1002 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 C1orf112Q9NSG2 853 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 PARVAQ9NVD7 372 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 BTBD7Q9P203 1132 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CNTN3Q9P232 1028 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SLC17A7Q9P2U7 560 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 JAG2Q9Y219 1238 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CLUHO75153 1309 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SLX4Q8IY92 1834 aa11.32□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 PSMD10O75832 226 aa11.31□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 IL1R1P14778 569 aa11.31□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 BGNP21810 368 aa11.31□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 GPX6P59796 221 aa11.31□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 PTK7Q13308 1070 aa11.31□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 KRT81Q14533 505 aa11.31□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 C1orf220Q5T0J3 134 aa11.31□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TRAPPC3LQ5T215 181 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 504.9 ms