RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	KIF22	Q14807	665 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CRB1	P82279	1406 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089		M0QYG6	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PLSCR1	O15162	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	NPHP1	O15259	732 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	LAMTOR5	O43504	91 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	AGFG2	O95081	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TH	P07101	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TEC	P42680	631 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF365	Q70YC5	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	MED25	Q71SY5	747 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	MB21D1	Q8N884	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	MYOM1	P52179	1685 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	NBN	O60934	754 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	RASSF9	O75901	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	UNC5C	O95185	931 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ANXA1	P04083	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ITGB1	P05556	798 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	GRP	P07492	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	HK1	P19367	917 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	MGAT1	P26572	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PPM1A	P35813	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	HHEX	Q03014	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CTBP1	Q13363	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	STARD3	Q14849	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ELF2	Q15723	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	DOK3	Q7L591	496 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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