RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 RNF181Q9P0P0 153 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 NOX1Q9Y5S8 564 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ERVK-7P63135 1459 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 MBD5Q9P267 1494 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 UBR1Q8IWV7 1749 aa4.8□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM191CA6NGB0 347 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 MGST3O14880 152 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PROM1O43490 865 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PARNO95453 639 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ELFN1P0C7U0 828 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 SRGNP10124 158 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TGFB2P61812 414 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF844Q08AG5 666 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 FSTL1Q12841 308 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 GRM3Q14832 879 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 MLC1Q15049 377 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 SPDYE7PQ495Y7 208 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 VWA1Q6PCB0 445 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 FOXR2Q6PJQ5 311 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CLNKQ7Z7G1 428 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 FAM109AQ8N4B1 249 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 B3GNT5Q9BYG0 378 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 KCTD5Q9NXV2 234 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 L1RE1Q9UN81 338 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa4.79□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 AFF2P51816 1311 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ABCC3O15438 1527 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 NCOA2Q15596 1464 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 WDR27A2RRH5 827 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 E7ENX8 843 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 RAMP2O60895 175 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 VPS4BO75351 444 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CHEK2O96017 543 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CHRM3P20309 590 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF134P52741 427 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 SOX8P57073 446 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 RPS7P62081 194 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TAP2Q03519 686 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 OLFML1Q6UWY5 402 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 SLC30A10Q6XR72 485 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 Q6ZNX1 250 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 SLC44A3Q8N4M1 653 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CAMKK1Q8N5S9 505 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PSD4Q8NDX1 1056 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 AIFM2Q9BRQ8 373 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 DPH1Q9BZG8 443 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 INTS13Q9NVM9 706 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 CPA4Q9UI42 421 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 MED16Q9Y2X0 877 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 PIK3C2BO00750 1634 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 LRP6O75581 1613 aa4.78□□□□□ -1.64
CLVS1-209ENST00000522928 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 USP19O94966 1318 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 VSTM5A8MXK1 200 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 MYO1FO00160 1098 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 GNAI3P08754 354 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 HKR1P10072 659 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ATF3P18847 181 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 GNAI1P63096 354 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 PIGFQ07326 219 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 FGL2Q14314 439 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 LLGL1Q15334 1064 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 APOA5Q6Q788 366 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 MICALCLQ6ZW33 695 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 LCORLQ8N3X6 602 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 IL31RAQ8NI17 732 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 MAML1Q92585 1016 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ANKS1AQ92625 1134 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 PDLIM2Q96JY6 352 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 CNPPD1Q9BV87 410 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 C22orf23Q9BZE7 217 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 CYP4F11Q9HBI6 524 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 TBCCD1Q9NVR7 557 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM2Q9UHN6 1383 aa4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms