RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517488.1

PDGFRB-202, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene PDGFRB, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-202ENST00000517488 CETN3O15182 167 aa15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 CLSTN1O94985 981 aa15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 HLA-DRAP01903 254 aa15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 KRT13P13646 458 aa15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 AOC1P19801 751 aa15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 BDNFP23560 247 aa15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 CDC25CP30307 473 aa15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 MAGEA11P43364 429 aa15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 CYP27A1Q02318 531 aa15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 GPR158Q5T848 1215 aa15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 ANKRD40Q6AI12 368 aa15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 SPOPLQ6IQ16 392 aa15.05■□□□□ -0
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PDGFRB-202ENST00000517488 C4orf50Q6ZRC1 276 aa15.05■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 SCN4BQ8IWT1 228 aa15.05■□□□□ -0
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PDGFRB-202ENST00000517488 TRIM49BA6NDI0 452 aa15.04■□□□□ -0
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PDGFRB-202ENST00000517488 CSH2P0DML3 217 aa15.04■□□□□ -0
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PDGFRB-202ENST00000517488 NLRP12P59046 1061 aa15.04■□□□□ -0
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PDGFRB-202ENST00000517488 SLC46A2Q9BY10 475 aa15.04■□□□□ -0
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PDGFRB-202ENST00000517488 TADA3O75528 432 aa15.02■□□□□ -0
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PDGFRB-202ENST00000517488 TXNDC8Q6A555 127 aa15.02■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa15.02■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 SEMA4DQ92854 862 aa15.02■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 MYRFLQ96LU7 910 aa15.02■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 BRD9Q9H8M2 597 aa15.02■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 HMGXB4Q9UGU5 601 aa15.02■□□□□ -0
PDGFRB-202ENST00000517488 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa15.01□□□□□ -0.01
PDGFRB-202ENST00000517488 F8VP50 259 aa15.01□□□□□ -0.01
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