RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDGFRB	P09619	1106 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM163B	P0C2L3	166 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMC3	P17980	439 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD72	P21854	359 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	GDI1	P31150	447 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATIC	P31939	592 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGEA11	P43364	429 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDH8	P55286	799 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCOA4	Q13772	614 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	VEPH1	Q14D04	833 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCED1B	Q96HM7	432 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYRFL	Q96LU7	910 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMS19	Q96T76	1030 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	TASP1	Q9H6P5	420 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	FGF19	O95750	216 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	BDNF	P23560	247 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	NR2F2	P24468	414 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDC25C	P30307	473 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	AP3M2	P53677	418 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CACNA2D1	P54289	1103 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP3CA	Q08209	521 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRPC3	Q13507	836 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SV2A	Q7L0J3	742 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SHD	Q96IW2	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	PATJ	Q8NI35	1801 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	STK25	O00506	426 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	IKBKB	O14920	756 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM49	P0CI25	452 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM49C	P0CI26	452 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSH1	P0DML2	217 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CSH2	P0DML3	217 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRCP	P42785	496 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRE11	P49959	708 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP46	P62068	366 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TNNC1	P63316	161 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	BIRC3	Q13489	604 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF699	Q32M78	642 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	WDR44	Q5JSH3	913 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	E2F7	Q96AV8	911 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIGD1	Q96MW7	591 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	OBP2A	Q9NY56	170 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCL26	Q9Y258	94 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFAP54	Q96N23	3096 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLDN5	O00501	218 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHAD	O15335	359 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	PHACTR2	O75167	634 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIF20A	O95235	890 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	HLA-DRA	P01903	254 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	VAMP7	P51809	220 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ENPEP	Q07075	957 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANGPT1	Q15389	498 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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