RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM49P0CI25 452 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM49CP0CI26 452 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MYL4P12829 197 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 FMO5P49326 533 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 FOXK2Q01167 660 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 UBXN1Q04323 297 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 NR1I3Q14994 352 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 FAM78AQ5JUQ0 283 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MIIPQ5JXC2 388 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PRSS36Q5K4E3 855 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 CYP4A22Q5TCH4 519 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TPGS2Q68CL5 300 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 JADE1Q6IE81 842 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 IQCEQ6IPM2 695 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM130Q8N3G9 435 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 BEST2Q8NFU1 509 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PLEKHO2Q8TD55 490 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 OSBPL6Q9BZF3 934 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MMRN2Q9H8L6 949 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM8AQ9HCN3 771 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 INTS13Q9NVM9 706 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PCDHB8Q9UN66 801 aa12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 USP34Q70CQ2 3546 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 GJA1P17302 382 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 CYP3A5P20815 502 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 FCARP24071 287 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TARSP26639 723 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 CCR2P41597 374 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 GCLMP48507 274 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MXI1P50539 228 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PPP3CAQ08209 521 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TWF1Q12792 350 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 BIRC3Q13489 604 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 C1orf220Q5T0J3 134 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF852Q6ZMS4 543 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 GBP6Q6ZN66 633 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 SV2AQ7L0J3 742 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ELSPBP1Q96BH3 223 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PGLYRP2Q96PD5 576 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 NELL2Q99435 816 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 BRD9Q9H8M2 597 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ZFP14Q9HCL3 533 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 CEP72Q9P209 647 aa12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 DOCK8Q8NF50 2099 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 NCAM2O15394 837 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 NFICP08651 508 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 OR4Q2P0C623 313 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 WNT7BP56706 349 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MYL7Q01449 175 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TRPC3Q13507 836 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ZBTB6Q15916 424 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ZACNQ401N2 412 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 DSTYKQ6XUX3 929 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ERMP1Q7Z2K6 904 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 EFCAB13Q8IY85 973 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 DCLK2Q8N568 766 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC150Q8NCX0 1101 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 FBXL13Q8NEE6 735 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 OR5B17Q8NGF7 314 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF516Q92618 1163 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 RUBCNQ92622 972 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 DNASE1L2Q92874 299 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ZSWIM3Q96MP5 696 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ASB16Q96NS5 453 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ASAH2Q9NR71 780 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 DPP3Q9NY33 737 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 FBXO4Q9UKT5 387 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ITGA11Q9UKX5 1188 aa12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 VWA8A3KMH1 1905 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1W2PQC6 194 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 M0QZQ0 153 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TEX33O43247 280 aa12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms