RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KMT2EQ8IZD2 1858 aa12.93□□□□□ -0.34
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 FGF19O95750 216 aa12.91□□□□□ -0.34
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 NPR3P17342 541 aa12.91□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AVPR2P30518 371 aa12.91□□□□□ -0.34
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 STIM1Q13586 685 aa12.91□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa12.91□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 C4orf50Q6ZRC1 276 aa12.91□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM105Q8N8V8 129 aa12.91□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa12.91□□□□□ -0.34
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 PCED1BQ96HM7 432 aa12.91□□□□□ -0.34
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa12.91□□□□□ -0.34
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 PSMA7O14818 248 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PI15O43692 258 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LRRN2O75325 713 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CSH1P0DML2 217 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CSH2P0DML3 217 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 P4HA1P13674 534 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 STX17P56962 302 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NLRP12P59046 1061 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CFAP221Q4G0U5 840 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TCERG1LQ5VWI1 586 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FOXR2Q6PJQ5 311 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 VITQ6UXI7 678 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RSPRY1Q96DX4 576 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP12.9□□□□□ -0.34
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RAB30-AS1-201ENST00000501011 MKNK1Q9BUB5 465 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GPR88Q9GZN0 384 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TBC1D17Q9HA65 648 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARHGEF3Q9NR81 526 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HMGXB4Q9UGU5 601 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CTNND2Q9UQB3 1225 aa12.9□□□□□ -0.34
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ASS1P00966 412 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
RAB30-AS1-201ENST00000501011 F11P03951 625 aa12.89□□□□□ -0.35
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM163BP0C2L3 166 aa12.89□□□□□ -0.35
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCNE1P24864 410 aa12.89□□□□□ -0.35
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ANXA13P27216 316 aa12.89□□□□□ -0.35
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDC25CP30307 473 aa12.89□□□□□ -0.35
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GDI1P31150 447 aa12.89□□□□□ -0.35
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PPP1R2P41236 205 aa12.89□□□□□ -0.35
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAGEA11P43364 429 aa12.89□□□□□ -0.35
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CACNA2D1P54289 1103 aa12.89□□□□□ -0.35
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NOP14P78316 857 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LRRC63Q05C16 580 aa12.89□□□□□ -0.35
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SLC44A4Q53GD3 710 aa12.89□□□□□ -0.35
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TMEM150AQ86TG1 271 aa12.89□□□□□ -0.35
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ACOT1Q86TX2 421 aa12.89□□□□□ -0.35
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