RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 FRMD3A2A2Y4 597 aa21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 GDF9O60383 454 aa21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 ATG13O75143 517 aa21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 GCNT3O95395 438 aa21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 RRAGBQ5VZM2 374 aa21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 OSTM1Q86WC4 334 aa21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 SPATA18Q8TC71 538 aa21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 GAB3Q8WWW8 586 aa21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 MYRFLQ96LU7 910 aa21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 GDAP2Q9NXN4 497 aa21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 ITGA11Q9UKX5 1188 aa21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 SDK1Q7Z5N4 2213 aa21.38■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 HUS1O60921 280 aa21.37■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 ARSAP15289 507 aa21.37■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 CYP2F1P24903 491 aa21.37■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 MYL7Q01449 175 aa21.37■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 DDR2Q16832 855 aa21.37■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 LOXL4Q96JB6 756 aa21.37■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 CLIC6Q96NY7 704 aa21.37■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa21.37■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa21.37■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 GABRDO14764 452 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 EGFP01133 1207 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 TXLNAP40222 546 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 RAP1GAPP47736 663 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 AMPD2Q01433 879 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 ALCAMQ13740 583 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 PDGFRLQ15198 375 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 PPM1JQ5JR12 505 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 FAM84AQ96KN4 292 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 CBWD1Q9BRT8 395 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 SIX4Q9UIU6 781 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 GTF3C4Q9UKN8 822 aa21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 RNF40O75150 1001 aa21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 RPP40O75818 363 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 EPN2O95208 641 aa21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 DRD1P21728 446 aa21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 GJA4P35212 333 aa21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 PXNP49023 591 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 USP4Q13107 963 aa21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 MTF1Q14872 753 aa21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 ZNF77Q15935 545 aa21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 CCDC142Q17RM4 750 aa21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 TMEM206Q9H813 350 aa21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.35■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 HCRTO43612 131 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 AKAP3O75969 853 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 IDEP14735 1019 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 LHX1P48742 406 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 GALK1P51570 392 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 LIMK1P53667 647 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 RBP5P82980 135 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 ADGRF2Q8IZF7 708 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 SYCP3Q8IZU3 236 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 CAMKK1Q8N5S9 505 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 SLC22A12Q96S37 553 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 MTMR12Q9C0I1 747 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 ECT2Q9H8V3 914 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 LAMA1P25391 3075 aa21.34■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 A0A087X0B3 334 aa21.33■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 AXIN1O15169 862 aa21.33■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 KRT19P08727 400 aa21.33■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 ZNF806P0C7X5 589 aa21.33■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 PCSK1P29120 753 aa21.33■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 SOWAHAQ2M3V2 549 aa21.33■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 FBXO43Q4G163 708 aa21.33■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 FAM171BQ6P995 826 aa21.33■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.33■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 KBTBD6Q86V97 674 aa21.33■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 GPD1LQ8N335 351 aa21.33■■□□□ 1.01
NELFE-212ENST00000492539 CPA6Q8N4T0 437 aa21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms