RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488814.5

FUBP1-210, Transcript of far upstream element binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene FUBP1, Length 612 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1-210ENST00000488814 EPHA4P54764 986 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 CAP1Q01518 475 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 MGAT3Q09327 533 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 PAK2Q13177 524 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 ELF2Q15723 593 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 ZNF394Q53GI3 561 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 TBCELQ5QJ74 424 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 UBXN11Q5T124 520 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 NAA35Q5VZE5 725 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 C11orf63Q6NUN7 778 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 PASD1Q8IV76 773 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 TNS4Q8IZW8 715 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 TMEM35BQ8NCS4 154 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 MSANTD4Q8NCY6 345 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 RABGGTAQ92696 567 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 ZNF560Q96MR9 790 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 MMS19Q96T76 1030 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 NUP85Q9BW27 656 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 BCO2Q9BYV7 579 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 KLK14Q9P0G3 267 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 SIX4Q9UIU6 781 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 HES2Q9Y543 173 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 IPPQ9Y573 584 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 SCINQ9Y6U3 715 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.96□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 FAM170AA1A519 330 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 CES2O00748 559 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 KCNK3O14649 394 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 MTA2O94776 668 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 ARHGEF15O94989 841 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 LSM8O95777 96 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 CYP1A2P05177 515 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 CALB1P05937 261 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 VDRP11473 427 aa6.95□□□□□ -1.3
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FUBP1-210ENST00000488814 BRD2P25440 801 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 RAB27AP51159 221 aa6.95□□□□□ -1.3
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FUBP1-210ENST00000488814 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 SV2CQ496J9 727 aa6.95□□□□□ -1.3
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FUBP1-210ENST00000488814 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 SIX5Q8N196 739 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 USP38Q8NB14 1042 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 PGBD4Q96DM1 585 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.95□□□□□ -1.3
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FUBP1-210ENST00000488814 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 TLR10Q9BXR5 811 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 LCMT1Q9UIC8 334 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.95□□□□□ -1.3
FUBP1-210ENST00000488814 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.95□□□□□ -1.3
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