RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483538.1

POLR1A-207, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-207ENST00000483538 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 DDR2Q16832 855 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 OTOP3Q7RTS5 596 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 FUKQ8N0W3 1084 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 OR6B3Q8NGW1 331 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 GIPC2Q8TF65 315 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 FGF14Q92915 247 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 KAT5Q92993 513 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 TATDN2Q93075 761 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 ZSWIM3Q96MP5 696 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 B3GNT5Q9BYG0 378 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 ELOVL4Q9GZR5 314 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 LIMD1Q9UGP4 676 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 CDH7Q9ULB5 785 aa9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 A0A1W2PRU2 124 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 A8MXQ7 604 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 GOLGA6L22H0YM25 854 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 PMM2O15305 246 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 DCXO43602 365 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 NARSO43776 548 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 STX10O60499 249 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 NOL4O94818 638 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 MYL4P12829 197 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 BDNFP23560 247 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 MAGEA11P43364 429 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 ALDH1A3P47895 512 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 EPHB3P54753 998 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 USP46P62068 366 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 CYP27A1Q02318 531 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 KCNH2Q12809 1159 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 PLD1Q13393 1074 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 TEAD2Q15562 447 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 CCDC40Q4G0X9 1142 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 PARM1Q6UWI2 310 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 ACOT1Q86TX2 421 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 FAM35AQ86V20 835 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 ARHGEF19Q8IW93 802 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 CRYBG2Q8N1P7 616 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 C12orf29Q8N999 325 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 HSD3B7Q9H2F3 369 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 SNX25Q9H3E2 840 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 KCNK12Q9HB15 430 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 ASAH2Q9NR71 780 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.49□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 SLC38A8A6NNN8 435 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 BEST1O76090 585 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 MICAL2O94851 1124 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 GNA14O95837 355 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 F11P03951 625 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 P4HA1P13674 534 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 CD58P19256 250 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 ACO1P21399 889 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 RAD23BP54727 409 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 CYP4F8P98187 520 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 APBA1Q02410 837 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 LRMPQ12912 555 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 CUL2Q13617 745 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 FAM78AQ5JUQ0 283 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 MIIPQ5JXC2 388 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 VSTM1Q6UX27 236 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 UNC93AQ86WB7 457 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 ZMIZ2Q8NF64 920 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 RIN3Q8TB24 985 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 ASIC4Q96FT7 647 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 FAXDC2Q96IV6 333 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 MYRFLQ96LU7 910 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 KREMEN1Q96MU8 473 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 FUCA2Q9BTY2 467 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 IMPG2Q9BZV3 1241 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 THAP9Q9H5L6 903 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 CYP3A43Q9HB55 503 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-207ENST00000483538 KRT82Q9NSB4 513 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms