RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CTAGE3PQ8IX95 158 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 RIT2Q99578 217 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SLC17A7Q9P2U7 560 aa17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 VAV1P15498 845 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ARSEP51690 589 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM62Q0P6H9 643 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 BBS9Q3SYG4 887 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SWSAP1Q6NVH7 229 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 OLFM3Q96PB7 478 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 GINM1Q9NU53 330 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 BGNP21810 368 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SSTR1P30872 391 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PTGER2P43116 358 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 GALK1P51570 392 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 HMGCS2P54868 508 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 BPIFB4P59827 614 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PGM5Q15124 567 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 RASA2Q15283 850 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TRIP10Q15642 601 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CIAPIN1Q6FI81 312 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PASD1Q8IV76 773 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PALM2Q8IXS6 379 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 USP6NLQ92738 828 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SEMA4DQ92854 862 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 FAM111AQ96PZ2 611 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ECSITQ9BQ95 431 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 NUMBLQ9Y6R0 609 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SGK1O00141 431 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 C2CD2LO14523 706 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SLC26A4O43511 780 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SEZ6Q53EL9 994 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 RABGAP1LQ5R372 815 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM63BQ5T3F8 832 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf63Q6NUN7 778 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 DLK2Q6UY11 383 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 NLRX1Q86UT6 975 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CPA5Q8WXQ8 436 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 GATA6Q92908 595 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 KMT5AQ9NQR1 393 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 RNF146Q9NTX7 359 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 DMAC2Q9NW81 257 aa17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TTC36A6NLP5 189 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 MT-ND3P03897 115 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SCUBE1Q8IWY4 988 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 C10orf88Q9H8K7 445 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF212Q9UDV6 495 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 FGFR1P11362 822 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM42Q8IWZ5 723 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TAS1R2Q8TE23 839 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 FAM213AQ9BRX8 229 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 OSBPL8Q9BZF1 889 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PHACTR1Q9C0D0 580 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 NMUR2Q9GZQ4 415 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM206Q9H813 350 aa16.99■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 INHBCP55103 352 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 MTERF2Q49AM1 385 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 MCF2L2Q86YR7 1114 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 FBXO27Q8NI29 283 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PYROXD1Q8WU10 500 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC19Q9H756 370 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 BSNDQ8WZ55 320 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 DCLK3Q9C098 648 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SAR1AQ9NR31 198 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 PPM1HQ9ULR3 514 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 LPXNO60711 386 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 NPTX2P47972 431 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 HSD17B4P51659 736 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ACAP1Q15027 740 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 EEPD1Q7L9B9 569 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 QSER1Q2KHR3 1735 aa16.98■□□□□ 0.31
CCSAP-204ENST00000483092 CDK7P50613 346 aa16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms