RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482419.1

FAM208B-208, Transcript of family with sequence similarity 208 member B, human

TSL 2

Gene FAM208B, Length 424 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM208B-208	ENST00000482419	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ADM5	C9JUS6	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ORC4	O43929	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	MGEA5	O60502	916 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	RHO	P08100	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	BMP5	P22003	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	LRPAP1	P30533	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	GRIA3	P42263	894 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	INHBE	P58166	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	E2F2	Q14209	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	MAML1	Q92585	1016 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	APIP	Q96GX9	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	PBK	Q96KB5	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	MGST3	O14880	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	KIF3B	O15066	747 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	PPM1D	O15297	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	PEX2	P28328	305 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	FMO1	Q01740	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	RFK	Q969G6	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ZG16B	Q96DA0	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	INSL6	Q9Y581	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	NUDT3	O95989	172 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	KRT17	Q04695	432 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	TBCC	Q15814	346 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	TLR5	O60602	858 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	PDHA1	P08559	390 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	NR2F6	P10588	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM208B-208	ENST00000482419	DGKE	P52429	567 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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