RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482054.1

CTSL-205, Transcript of cathepsin L, human

TSL 2

Gene CTSL, Length 908 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSL-205	ENST00000482054	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	BFSP1	Q12934	665 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	RUNX3	Q13761	415 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	PTPA	Q15257	358 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	TXNDC8	Q6A555	127 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	USP49	Q70CQ1	688 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	EDEM2	Q9BV94	578 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	EBF3	Q9H4W6	596 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	TDP1	Q9NUW8	608 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	ANK1	P16157	1881 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	ACACA	Q13085	2346 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	C4orf47	A7E2U8	309 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	IL18RAP	O95256	599 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	ARSA	P15289	507 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	POLR2B	P30876	1174 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	TSPY1	Q01534	308 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	KCNA1	Q09470	495 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	POSTN	Q15063	836 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	BRAP	Q7Z569	592 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	EPSTI1	Q96J88	318 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF560	Q96MR9	790 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	STRA6	Q9BX79	667 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	ADAMTS20	P59510	1910 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	APC2	O95996	2303 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	TADA3	O75528	432 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	EGF	P01133	1207 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	ITGB3	P05106	788 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	CSH1	P0DML2	217 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	CSH2	P0DML3	217 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	PNPLA4	P41247	253 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	DDR2	Q16832	855 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	MON1A	Q86VX9	555 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	SAAL1	Q96ER3	474 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CTSL-205	ENST00000482054	MYMK	A6NI61	221 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	RNF40	O75150	1001 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	AKAP3	O75969	853 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	CEACAM1	P13688	526 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	CYP2F1	P24903	491 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	PLK5	Q496M5	336 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	FAM84A	Q96KN4	292 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	PKMYT1	Q99640	499 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	ACBD6	Q9BR61	282 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	STK17A	Q9UEE5	414 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CTSL-205	ENST00000482054	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		13.89	□□□□□ -0.19

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