RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 GPT2Q8TD30 523 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 PCED1BQ96HM7 432 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 MED15Q96RN5 788 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 BCO2Q9BYV7 579 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 MAGEA11P43364 429 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 TEAD2Q15562 447 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 CBWD6Q4V339 395 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 ASIC4Q96FT7 647 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 IL21Q9HBE4 155 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 RAB20Q9NX57 234 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PRU2 124 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 TMEM221A6NGB7 291 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 PRR33A8MZF0 331 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 M0R296 226 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 NARSO43776 548 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 BDNFP23560 247 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 CYP27A1Q02318 531 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 VSTM1Q6UX27 236 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 MTSS1LQ765P7 747 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 STKLD1Q8NE28 680 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 GABRR2P28476 465 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 MLKLQ8NB16 471 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 FGF19O95750 216 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 CSH1P0DML2 217 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 CSH2P0DML3 217 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 NDST1P52848 882 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 TAF12Q16514 161 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 UNC93AQ86WB7 457 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 TNIP3Q96KP6 325 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 ASB16Q96NS5 453 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 GPR88Q9GZN0 384 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 CLDN5O00501 218 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 ECI2O75521 394 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 NOL4O94818 638 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 GNA14O95837 355 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 F11P03951 625 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 FCARP24071 287 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 FMO5P49326 533 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 INCA1Q0VD86 236 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 ORC1Q13415 861 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 ACOT1Q86TX2 421 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 TATDN2Q93075 761 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 TWNKQ96RR1 684 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 KXD1Q9BQD3 176 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.31■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 PMM2O15305 246 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 CDC25CP30307 473 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 GRIK1P39086 918 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 CACNA2D1P54289 1103 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 NLRP12P59046 1061 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 WHAMMQ8TF30 809 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 SMARCD2Q92925 531 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 SPATA17Q96L03 361 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 C8orf48Q96LL4 319 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 MYRFLQ96LU7 910 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 CILPO75339 1184 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 SRFP11831 508 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 CYP4F8P98187 520 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 WDR44Q5JSH3 913 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 GPR158Q5T848 1215 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-211ENST00000480301 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.29■■□□□ 1.16
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