RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476646.5

NFIA-209, Transcript of nuclear factor I A, human

TSL 3

Gene NFIA, Length 730 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIA-209	ENST00000476646	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ERICH1	Q86X53	443 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CD302	Q8IX05	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	BHMT	Q93088	406 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	DPH5	Q9H2P9	285 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ZFAT	Q9P243	1243 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646		A0A0B4J269	797 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TISP43	B9A030	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646		M0QZ92	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ACKR2	O00590	384 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TTI1	O43156	1089 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	DAPK3	O43293	454 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	MMP20	O60882	483 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PROSC	O94903	275 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	GLI1	P08151	1106 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	KRT7	P08729	469 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	RARA	P10276	462 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	MCF2	P10911	925 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	GNAT1	P11488	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CD58	P19256	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ITIH2	P19823	946 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	NFKB1	P19838	968 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	NR1D1	P20393	614 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	GJC1	P36383	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ADCY8	P40145	1251 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	MAPK8	P45983	427 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PMS2	P54278	862 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PLTP	P55058	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	FKBP1B	P68106	108 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	IGBP1	P78318	339 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	FMO1	Q01740	532 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CAPS	Q13938	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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