RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 MAGEA11P43364 429 aa21.23■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 PAK1Q13153 545 aa21.23■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.23■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 TCERG1LQ5VWI1 586 aa21.23■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 VSTM1Q6UX27 236 aa21.23■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 GAREM2Q75VX8 874 aa21.23■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.23■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.23■□□□□ 0.99
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CTPS1-206ENST00000470271 KXD1Q9BQD3 176 aa21.23■□□□□ 0.99
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CTPS1-206ENST00000470271 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.23■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.23■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.23■□□□□ 0.99
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CTPS1-206ENST00000470271 CSH1P0DML2 217 aa21.22■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 CSH2P0DML3 217 aa21.22■□□□□ 0.99
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CTPS1-206ENST00000470271 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.22■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.22■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.22■□□□□ 0.99
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CTPS1-206ENST00000470271 SMARCD2Q92925 531 aa21.22■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 ASB16Q96NS5 453 aa21.22■□□□□ 0.99
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CTPS1-206ENST00000470271 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
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CTPS1-206ENST00000470271 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa21.22■□□□□ 0.99
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CTPS1-206ENST00000470271 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 STX17P56962 302 aa21.21■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa21.21■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 TANGO2Q6ICL3 276 aa21.21■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.21■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.21■□□□□ 0.99
CTPS1-206ENST00000470271 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
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CTPS1-206ENST00000470271 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
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CTPS1-206ENST00000470271 RAB20Q9NX57 234 aa21.21■□□□□ 0.99
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CTPS1-206ENST00000470271 SEMA4DQ92854 862 aa21.2■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 BCO2Q9BYV7 579 aa21.2■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.2■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.2■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.2■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.2■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 WNT16Q9UBV4 365 aa21.2■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 LRRN2O75325 713 aa21.19■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 NDST1P52848 882 aa21.19■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 GPC5P78333 572 aa21.19■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.19■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 GPR158Q5T848 1215 aa21.19■□□□□ 0.98
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CTPS1-206ENST00000470271 SLC35C1Q96A29 364 aa21.19■□□□□ 0.98
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CTPS1-206ENST00000470271 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.19■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.19■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa21.19■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 TRPV4Q9HBA0 871 aa21.19■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.18■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM66O15016 1216 aa21.18■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 ANXA13P27216 316 aa21.18■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 NLRP12P59046 1061 aa21.18■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 CYP4F8P98187 520 aa21.18■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 INCA1Q0VD86 236 aa21.18■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 ACOT1Q86TX2 421 aa21.18■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 SIX5Q8N196 739 aa21.18■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.18■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 MYRFLQ96LU7 910 aa21.18■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.18■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.18■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 TASP1Q9H6P5 420 aa21.18■□□□□ 0.98
CTPS1-206ENST00000470271 HMGXB4Q9UGU5 601 aa21.18■□□□□ 0.98
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