RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465393.1

TNIK-208, Transcript of TRAF2 and NCK interacting kinase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNIK, Length 750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIK-208ENST00000465393 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 SCN4BQ8IWT1 228 aa21.45■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 ADSSL1Q8N142 457 aa21.45■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 E2F7Q96AV8 911 aa21.45■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.45■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 NME7Q9Y5B8 376 aa21.45■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 OBSL1O75147 1896 aa21.45■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 GREB1Q4ZG55 1949 aa21.45■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 F5P12259 2224 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 A8MXQ7 604 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 HLA-DRAP01903 254 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 GCLMP48507 274 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 NUBP1P53384 320 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 LRRC63Q05C16 580 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 GPR158Q5T848 1215 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 IER5LQ5T953 404 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 VSTM1Q6UX27 236 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 TMEM105Q8N8V8 129 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 PCED1BQ96HM7 432 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 SHDQ96IW2 340 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 TBC1D17Q9HA65 648 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.44■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 STK25O00506 426 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 PSMA7O14818 248 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 PSMC3P17980 439 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 AOC1P19801 751 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 PPP1R2P41236 205 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 VIPR2P41587 438 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 NLRP12P59046 1061 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 UBE2HP62256 183 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 CYP4F8P98187 520 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 CYP27A1Q02318 531 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 PPP3CAQ08209 521 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 VITQ6UXI7 678 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 TASP1Q9H6P5 420 aa21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 NOL4O94818 638 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 BDNFP23560 247 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 GTF2H1P32780 548 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 CDH8P55286 799 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 PRKCQQ04759 706 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 GRM2Q14416 872 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 ANKRD40Q6AI12 368 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 ISM2Q6H9L7 571 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 MFSD6LQ8IWD5 586 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 STKLD1Q8NE28 680 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 DNASE1L2Q92874 299 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 MYRFLQ96LU7 910 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 DPEP3Q9H4B8 488 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 BRD9Q9H8M2 597 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.42■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 HEPACAM2A8MVW5 462 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 STX10O60499 249 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 F11P03951 625 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 CCNE1P24864 410 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.029e-8■■■□□ 18
TNIK-208ENST00000465393 WEE1P30291 646 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 GRIK1P39086 918 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 PLA2G5P39877 138 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 RAP1GAPP47736 663 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 STARD6P59095 220 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 TMEM150AQ86TG1 271 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 PRSS33Q8NF86 280 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 IRF7Q92985 503 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 FAM122AQ96E09 287 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 TNIP3Q96KP6 325 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 SPATA17Q96L03 361 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 SDCBP2Q9H190 292 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.41■■□□□ 1.02
TNIK-208ENST00000465393 PIEZO1Q92508 2521 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms