RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.83■■□□□ 1.25
ABCD4-202ENST00000460308 BDNFP23560 247 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 GRIK1P39086 918 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 MAGEA11P43364 429 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 NDST1P52848 882 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 EPHA5P54756 1037 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 DDR2Q16832 855 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 VSTM1Q6UX27 236 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 GPR152Q8TDT2 470 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 NXPE3Q969Y0 559 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 MED10Q9BTT4 135 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 KCNK12Q9HB15 430 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 GDE1Q9NZC3 331 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.82■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 PMM2O15305 246 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 P4HA2O15460 535 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 CSH1P0DML2 217 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 CSH2P0DML3 217 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 CEBPBP17676 345 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 CD58P19256 250 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 ANXA13P27216 316 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 GPR15P49685 360 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 KCNH2Q12809 1159 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 MTMR3Q13615 1198 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 ACOT1Q86TX2 421 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 TTC39CQ8N584 583 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 TATDN2Q93075 761 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 GCNAQ96QF7 691 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 MED15Q96RN5 788 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 ATP8B3O60423 1300 aa22.81■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 GABRR2P28476 465 aa22.8■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 CCR2P41597 374 aa22.8■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 MTSS1LQ765P7 747 aa22.8■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 TMC8Q8IU68 726 aa22.8■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.8■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 LRRC3Q9BY71 257 aa22.8■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.8■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.8■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.8■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 A0A1W2PRU2 124 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 TRIM66O15016 1216 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 GJA1P17302 382 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 ZXDAP98168 799 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 INCA1Q0VD86 236 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 LRMPQ12912 555 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 ORC1Q13415 861 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 TDGQ13569 410 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 TEAD2Q15562 447 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 EDAQ92838 391 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 GPR88Q9GZN0 384 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 THAP9Q9H5L6 903 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 ANO10Q9NW15 660 aa22.79■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.78■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 CDC25CP30307 473 aa22.78■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.78■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 UBALD2Q8IYN6 164 aa22.78■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.78■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.78■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 NT5C1BQ96P26 610 aa22.78■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.78■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.78■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 ANHXE9PGG2 379 aa22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 CLDN5O00501 218 aa22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 CILPO75339 1184 aa22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 MOSPD3O75425 235 aa22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 PTMSP20962 102 aa22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 HTR4Q13639 388 aa22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 STX1AQ16623 288 aa22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 PARM1Q6UWI2 310 aa22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 GAREM2Q75VX8 874 aa22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 SPATA17Q96L03 361 aa22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 CISHQ9NSE2 258 aa22.77■■□□□ 1.24
ABCD4-202ENST00000460308 F8VP50 259 aa22.76■■□□□ 1.23
ABCD4-202ENST00000460308 NOL4O94818 638 aa22.76■■□□□ 1.23
ABCD4-202ENST00000460308 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ABCD4-202ENST00000460308 CUL2Q13617 745 aa22.76■■□□□ 1.23
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF394Q53GI3 561 aa22.76■■□□□ 1.23
ABCD4-202ENST00000460308 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ABCD4-202ENST00000460308 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.76■■□□□ 1.23
ABCD4-202ENST00000460308 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms