RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449508.1

TOM1-211, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 4

Gene TOM1, Length 593 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-211ENST00000449508 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 TNNI1P19237 187 aa14.69□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 CXCL12P48061 93 aa14.69□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 CYP2J2P51589 502 aa14.69□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 CCR3P51677 355 aa14.69□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 NRLP54845 237 aa14.69□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 TNK2Q07912 1038 aa14.69□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 LRRC32Q14392 662 aa14.69□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 RESP18Q5W5W9 173 aa14.69□□□□□ -0.06
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TOM1-211ENST00000449508 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.69□□□□□ -0.06
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TOM1-211ENST00000449508 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.69□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.69□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 SCFD1Q8WVM8 642 aa14.69□□□□□ -0.06
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TOM1-211ENST00000449508 TDP1Q9NUW8 608 aa14.69□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 SOBPA7XYQ1 873 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 LILRB5O75023 590 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 ATP2C2O75185 946 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
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TOM1-211ENST00000449508 LMO2P25791 158 aa14.68□□□□□ -0.06
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TOM1-211ENST00000449508 EHHADHQ08426 723 aa14.68□□□□□ -0.06
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TOM1-211ENST00000449508 PKP1Q13835 747 aa14.68□□□□□ -0.06
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TOM1-211ENST00000449508 CCDC142Q17RM4 750 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.68□□□□□ -0.06
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TOM1-211ENST00000449508 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 MON1AQ86VX9 555 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 SYT15Q9BQS2 421 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 NCDNQ9UBB6 729 aa14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 CDH9Q9ULB4 789 aa14.68□□□□□ -0.06
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TOM1-211ENST00000449508 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.68□□□□□ -0.06
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TOM1-211ENST00000449508 GAS6Q14393 721 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 PSMD6Q15008 389 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 LIMS2Q7Z4I7 341 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 CEP57L1Q8IYX8 460 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 SPEM1Q8N4L4 309 aa14.67□□□□□ -0.06
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TOM1-211ENST00000449508 MYRFLQ96LU7 910 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 TRPC7Q9HCX4 862 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.67□□□□□ -0.06
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TOM1-211ENST00000449508 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.66□□□□□ -0.06
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TOM1-211ENST00000449508 GRIK1P39086 918 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 MAGEA11P43364 429 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 TRPC3Q13507 836 aa14.66□□□□□ -0.06
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TOM1-211ENST00000449508 WDR44Q5JSH3 913 aa14.66□□□□□ -0.06
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TOM1-211ENST00000449508 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 CGRRF1Q99675 332 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 EPC1Q9H2F5 836 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 SNX25Q9H3E2 840 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 EBF3Q9H4W6 596 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-211ENST00000449508 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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