RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447419.6

PTX4-203, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,516 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-203ENST00000447419 LRRC3Q9BY71 257 aa21.87■■□□□ 1.09
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PTX4-203ENST00000447419 KCNK12Q9HB15 430 aa21.87■■□□□ 1.09
PTX4-203ENST00000447419 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.87■■□□□ 1.09
PTX4-203ENST00000447419 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
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PTX4-203ENST00000447419 PARM1Q6UWI2 310 aa21.86■■□□□ 1.09
PTX4-203ENST00000447419 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.86■■□□□ 1.09
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PTX4-203ENST00000447419 C12orf29Q8N999 325 aa21.86■■□□□ 1.09
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PTX4-203ENST00000447419 CYP4F8P98187 520 aa21.85■■□□□ 1.09
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PTX4-203ENST00000447419 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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PTX4-203ENST00000447419 MAGEA11P43364 429 aa21.8■■□□□ 1.08
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PTX4-203ENST00000447419 TANGO2Q6ICL3 276 aa21.8■■□□□ 1.08
PTX4-203ENST00000447419 UNC93AQ86WB7 457 aa21.8■■□□□ 1.08
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