RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.78□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADGRF2Q8IZF7 708 aa9.78□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.78□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 MCRS1Q96EZ8 462 aa9.78□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 SUSD3Q96L08 255 aa9.78□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
CCNDBP1-202ENST00000444658 NCAPGQ9BPX3 1015 aa9.78□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-202ENST00000444658 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-202ENST00000444658 HESX1Q9UBX0 185 aa9.78□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM59LQ9UK28 342 aa9.78□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-202ENST00000444658 CDH9Q9ULB4 789 aa9.78□□□□□ -0.84
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CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC8A3P57103 927 aa9.77□□□□□ -0.85
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CCNDBP1-202ENST00000444658 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCDC70Q6NSX1 233 aa9.77□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.77□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 DSTYKQ6XUX3 929 aa9.77□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa9.77□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 ACOT1Q86TX2 421 aa9.77□□□□□ -0.85
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CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM130Q8N3G9 435 aa9.77□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 MMGT1Q8N4V1 131 aa9.77□□□□□ -0.85
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CCNDBP1-202ENST00000444658 C11orf49Q9H6J7 331 aa9.77□□□□□ -0.85
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CCNDBP1-202ENST00000444658 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.76□□□□□ -0.85
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CCNDBP1-202ENST00000444658 IKBKEQ14164 716 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 MESDQ14696 234 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 PTPN20Q4JDL3 420 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 WSCD1Q658N2 575 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM171BQ6P995 826 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 XYLT1Q86Y38 959 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 PASD1Q8IV76 773 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 THEM5Q8N1Q8 247 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPATA4Q8NEY3 305 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 CASD1Q96PB1 797 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 CPXM1Q96SM3 734 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.851e-6■■■■□ 22.7
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM175Q9BSA9 504 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 DUSP16Q9BY84 665 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 PARD6BQ9BYG5 372 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 TBC1D13Q9NVG8 400 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM53CQ9NYF3 392 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.76□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCDC188H7C350 402 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 M0QYV0 167 aa9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CCNDBP1-202ENST00000444658 SYN3O14994 580 aa9.75□□□□□ -0.85
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