RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD22Q5VYY1 191 aa16.81■□□□□ 0.28
SHQ1-202ENST00000444040 PCGF5Q86SE9 256 aa16.81■□□□□ 0.28
SHQ1-202ENST00000444040 FAM228AQ86W67 206 aa16.81■□□□□ 0.28
SHQ1-202ENST00000444040 NAT8LQ8N9F0 302 aa16.81■□□□□ 0.28
SHQ1-202ENST00000444040 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM176AQ96HP8 235 aa16.81■□□□□ 0.28
SHQ1-202ENST00000444040 PHACTR1Q9C0D0 580 aa16.81■□□□□ 0.28
SHQ1-202ENST00000444040 BANF1O75531 89 aa16.81■□□□□ 0.28
SHQ1-202ENST00000444040 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
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