RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ANXA13P27216 316 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPAN7P41732 249 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMD7P51665 324 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 RAP1GDS1P52306 607 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 JAM2P57087 298 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 NAA20P61599 178 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 STAT4Q14765 748 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 NUP93Q8N1F7 819 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 DEPTORQ8TB45 409 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SCFD1Q8WVM8 642 aa8.8□□□□□ -1
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RABGEF1-203ENST00000439720 SNF8Q96H20 258 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC18Q9H819 358 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SIX2Q9NPC8 291 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.8□□□□□ -1
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RABGEF1-203ENST00000439720 TBX3O15119 743 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 P4HA2O15460 535 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ENO1P06733 434 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ITIH2P19823 946 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ADRA1DP25100 572 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PEX2P28328 305 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 CA8P35219 290 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ADCY8P40145 1251 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ACTR3P61158 418 aa8.8□□□□□ -1
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RABGEF1-203ENST00000439720 MTMR2Q13614 643 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 LPIN1Q14693 890 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 GRM4Q14833 912 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ACAP1Q15027 740 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
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RABGEF1-203ENST00000439720 CYP1B1Q16678 543 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 MYLK3Q32MK0 819 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 PAOXQ6QHF9 649 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 UNC5DQ6UXZ4 953 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 NEK8Q86SG6 692 aa8.8□□□□□ -1
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RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 OLIG1Q8TAK6 271 aa8.8□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.8□□□□□ -1
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RABGEF1-203ENST00000439720 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
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RABGEF1-203ENST00000439720 USP17L21D6R901 530 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 FCHO1O14526 889 aa8.79□□□□□ -1
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RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN3O15551 220 aa8.79□□□□□ -1
RABGEF1-203ENST00000439720 STRNO43815 780 aa8.79□□□□□ -1
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