RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 VCPP55072 806 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB16Q05516 673 aa15.68■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 MCL1Q07820 350 aa15.68■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 OASLQ15646 514 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 FOXB2Q5VYV0 432 aa15.68■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC62Q6P9F0 684 aa15.68■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 MFSD7Q6UXD7 560 aa15.68■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ATP11CQ8NB49 1132 aa15.68■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 FGD4Q96M96 766 aa15.68■□□□□ 0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa15.68■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PHACTR1Q9C0D0 580 aa15.68■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 SLC17A7Q9P2U7 560 aa15.68■□□□□ 0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 KRT1P04264 644 aa15.67■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.67■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa15.67■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa15.67■□□□□ 0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP15.67■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 DTX3LQ8TDB6 740 aa15.67■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRN2Q92932 1015 aa15.67■□□□□ 0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 WDR72Q3MJ13 1102 aa15.67■□□□□ 0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP24Q8N264 748 aa15.67■□□□□ 0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 PXMP2Q9NR77 195 aa15.67■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PDP2Q9P2J9 529 aa15.67■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 IP6K2Q9UHH9 426 aa15.67■□□□□ 0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 WDR64B1ANS9 1081 aa15.66■□□□□ 0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 SLC39A4Q6P5W5 647 aa15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PCGF5Q86SE9 256 aa15.66■□□□□ 0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 KRT82Q9NSB4 513 aa15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 RNF146Q9NTX7 359 aa15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 DENND3A2RUS2 1198 aa15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA8SH3BPF8 625 aa15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA8MH3BSY2 632 aa15.66■□□□□ 0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 POLE2P56282 527 aa15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 TNFAIP1Q13829 316 aa15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 FAM91A1Q658Y4 838 aa15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 CHSY1Q86X52 802 aa15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PARVAQ9NVD7 372 aa15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PIM2Q9P1W9 311 aa15.66■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA8RI6L899 631 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 SGK1O00141 431 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 DLDP09622 509 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 C4orf19Q8IY42 314 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ABRAQ8N0Z2 381 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 GPD1LQ8N335 351 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 DCAKDQ8WVC6 231 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa15.65■□□□□ 0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 IFNB1P01574 187 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 DHRS4L1P0CG22 281 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 TCF4P15884 667 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PTPN7P35236 360 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 RAP1GDS1P52306 607 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ARL4CP56559 192 aa15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
TOP3B-206ENST00000436282 WDR44Q5JSH3 913 aa15.65■□□□□ 0.1
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