RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431558.1

PRRT3-AS1-201, PRRT3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRT3-AS1, Length 614 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 TMEM174Q8WUU8 243 aa17.46■□□□□ 0.39
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PRRT3-AS1-201ENST00000431558 VRTNQ9H8Y1 702 aa17.42■□□□□ 0.38
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 GTSE1Q9NYZ3 720 aa17.42■□□□□ 0.38
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PRRT3-AS1-201ENST00000431558 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa17.42■□□□□ 0.38
PRRT3-AS1-201ENST00000431558 CALUO43852 315 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
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PRRT3-AS1-201ENST00000431558 RPS9P46781 194 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
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