RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429968.5

RBM39-212, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 2,149 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-212ENST00000429968 MAGEB2O15479 319 aa14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 HCRTO43612 131 aa14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 FAM107AO95990 144 aa14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GPD2P43304 727 aa14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 NDST1P52848 882 aa14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CCNA1P78396 465 aa14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GAD2Q05329 585 aa14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GRB14Q14449 540 aa14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CYP4X1Q8N118 509 aa14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 A0A1B0GUA9 196 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GMNCA6NCL1 334 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 A6NNZ2 444 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TTC4O95801 387 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 PFKMP08237 780 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 NRLP54845 237 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GDF10P55107 478 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 LRRC38Q5VT99 294 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ZNF365Q70YC5 407 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 DPP9Q86TI2 863 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ALLCQ8N6M5 410 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 PEBP4Q96S96 227 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 DPP3Q9NY33 737 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 PCSK1NQ9UHG2 260 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CEP83Q9Y592 693 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 BANF1O75531 89 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 COL1A2P08123 1366 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.064e-10■■■□□ 14.6
RBM39-212ENST00000429968 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ASB7Q9H672 318 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SNTG2Q9NY99 539 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.69□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 NPTXRO95502 500 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TNFAIP2Q03169 654 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ACVR2BQ13705 512 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 KIF12Q96FN5 646 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TINF2Q9BSI4 451 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ADAMTS10Q9H324 1103 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GRAP2O75791 330 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 TJP3O95049 919 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 AGTP01019 485 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 PTPN7P35236 360 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ARSEP51690 589 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 MFSD5Q6N075 450 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 CCDC89Q8N998 374 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 MCRS1Q96EZ8 462 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 ACAP3Q96P50 834 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 STRIP2Q9ULQ0 834 aa14.68□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 E5RJQ4 531 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 MED7O43513 233 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 STRNO43815 780 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GPR32O75388 356 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GABBR2O75899 941 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 DRD4P21917 467 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 MIPP30301 263 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 RGS7P49802 495 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 GTF2A2P52657 109 aa14.67□□□□□ -0.06
RBM39-212ENST00000429968 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms