RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 GUCY2FP51841 1108 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 PSMD2Q13200 908 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 PON2Q15165 354 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q6ZS52 159 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 C12orf56Q8IXR9 622 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 EFCAB13Q8IY85 973 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 SYCP3Q8IZU3 236 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 SHKBP1Q8TBC3 707 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM174Q8WUU8 243 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 SAAL1Q96ER3 474 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 PGLYRP2Q96PD5 576 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 GCNAQ96QF7 691 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM213AQ9BRX8 229 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRPV4Q9HBA0 871 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa11.68□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 ANO9A1A5B4 782 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 PPEF2O14830 753 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 IL18RAPO95256 599 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 FGF19O95750 216 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 LDHAP00338 332 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 CTHP32929 405 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM160A1Q05DH4 1040 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 GAS6Q14393 721 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNB1Q14721 858 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARMCX5Q6P1M9 558 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 DSTYKQ6XUX3 929 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 NT5DC4Q86YG4 428 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPD1LQ8N335 351 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 CXorf38Q8TB03 319 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPATA20Q8TB22 786 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCTD10Q9H3F6 313 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATXN3LQ9H3M9 355 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 PCIF1Q9H4Z3 704 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 LMBRD1Q9NUN5 540 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 EXOC1Q9NV70 894 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 HSPBP1Q9NZL4 362 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 OBSL1O75147 1896 aa11.67□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 NUP205Q92621 2012 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 GOLGA8IPA6NC78 632 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 K7ESF4 209 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 M0QZQ0 153 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 PIRO00625 290 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 XPOTO43592 962 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 MOSPD3O75425 235 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPP40O75818 363 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 FECHP22830 423 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 EPHA5P54756 1037 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 FCHO2Q0JRZ9 810 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM132DQ14C87 1099 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC6Q16204 474 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 TAF12Q16514 161 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 ITIH5Q86UX2 942 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 NELFCDQ8IXH7 590 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 SYNPOQ8N3V7 929 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 BEST2Q8NFU1 509 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 TIGD1Q96MW7 591 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 GTSE1Q9NYZ3 720 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC8A2Q9UPR5 921 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 SDK1Q7Z5N4 2213 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 MYO16Q9Y6X6 1858 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 NCANO14594 1321 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 PTPRJQ12913 1337 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 MYBPHLA2RUH7 354 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 HAX1O00165 279 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARNTLO00327 626 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATG13O75143 517 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR4Q2P0C623 313 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 GABRR2P28476 465 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 LIMK1P53667 647 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 LILRA4P59901 499 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3C-202ENST00000428892 DUSP4Q13115 394 aa11.65□□□□□ -0.54
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