RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427412.5

CITED1-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-204ENST00000427412 LRRC3BQ96PB8 259 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 TSPAN18Q96SJ8 248 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 LMBRD1Q9NUN5 540 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 RMND1Q9NWS8 449 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 NUP205Q92621 2012 aa16.05■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 LACTBL1A8MY62 500 aa16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 PRAMEF12O95522 483 aa16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 GARTP22102 1010 aa16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 KYAT1Q16773 422 aa16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 BMT2Q1RMZ1 405 aa16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 PPM1JQ5JR12 505 aa16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 WDR5BQ86VZ2 330 aa16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SYNPOQ8N3V7 929 aa16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 TTC9BQ8N6N2 239 aa16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 C2orf42Q9NWW7 574 aa16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 GTSE1Q9NYZ3 720 aa16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 HSPBP1Q9NZL4 362 aa16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 STYXL1Q9Y6J8 313 aa16.04■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 PPEF2O14830 753 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 TGFB1I1O43294 461 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 NFICP08651 508 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ODC1P11926 461 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 PAX3P23760 479 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 GABRR2P28476 465 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 GUCY2FP51841 1108 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 LILRA4P59901 499 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 PLCB2Q00722 1185 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SPATA1Q5VX52 437 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 JADE1Q6IE81 842 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ITIH5Q86UX2 942 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 GPD1LQ8N335 351 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 RDH13Q8NBN7 331 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ZFYVE19Q96K21 471 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 TMEM209Q96SK2 561 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 MAN1B1Q9UKM7 699 aa16.03■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 PTPRDP23468 1912 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 EXTL3O43909 919 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 KIF20AO95235 890 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CYP11A1P05108 521 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 LIMK1P53667 647 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 PON2Q15165 354 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 GPR158Q5T848 1215 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CBWD2Q8IUF1 395 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 BRSK2Q8IWQ3 736 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 OR10T2Q8NGX3 314 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 FAM200AQ8TCP9 573 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 BPIFB1Q8TDL5 484 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 FAM84AQ96KN4 292 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SENP8Q96LD8 212 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 GSDMAQ96QA5 445 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 ATXN3LQ9H3M9 355 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 TASP1Q9H6P5 420 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 IL21Q9HBE4 155 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa16.02■□□□□ 0.16
CITED1-204ENST00000427412 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 DPYSL4O14531 572 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CALUO43852 315 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 GDF9O60383 454 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 SOAT2O75908 522 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 LDHAP00338 332 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 ATF6P18850 670 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CDC25CP30307 473 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 WNT7BP56706 349 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 TMEM132DQ14C87 1099 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 KLHL10Q6JEL2 608 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CD302Q8IX05 232 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 GPT2Q8TD30 523 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 NUP62CLQ9H1M0 184 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CLSTN2Q9H4D0 955 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 ZMYM5Q9UJ78 669 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 DERAQ9Y315 318 aa16.01■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 ANO9A1A5B4 782 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 PIRO00625 290 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 EXOC3O60645 756 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 NR3C1P04150 777 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CYP4F8P98187 520 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 TNK2Q07912 1038 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 ST3GAL2Q16842 350 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 C9orf57Q5W0N0 161 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 CEP135Q66GS9 1140 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 EFCAB13Q8IY85 973 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 XXYLT1Q8NBI6 393 aa16■□□□□ 0.15
CITED1-204ENST00000427412 GOLGA5Q8TBA6 731 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms