RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 NOMO2Q5JPE7 1267 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 C3orf38Q5JPI3 329 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 SYCE2Q6PIF2 218 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF783Q6ZMS7 281 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF365Q70YC5 407 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 PDSS2Q86YH6 399 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 SIMC1Q8NDZ2 872 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 POF1BQ8WVV4 589 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 BRI3BPQ8WY22 251 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 NELL1Q92832 810 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 KIAA1191Q96A73 305 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 NACC2Q96BF6 587 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 DUSP26Q9BV47 211 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 BRD9Q9H8M2 597 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 CERS4Q9HA82 394 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 GPR35Q9HC97 309 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 ARFGAP3Q9NP61 516 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 SACM1LQ9NTJ5 587 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 CFAP97Q9P2B7 532 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 TLK1Q9UKI8 766 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 PCSK5Q92824 1860 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 TRGV11A0A075B6L2 103 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 A0A1W2PPC4 97 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 MASP2O00187 686 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 BTN3A1O00481 513 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 APOL1O14791 398 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 DNAJB5O75953 348 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 FGF18O76093 207 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 ANXA1P04083 346 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 THP07101 528 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 RARBP10826 455 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 FCER1AP12319 257 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 ABCB4P21439 1286 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 CD38P28907 300 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 PPM1AP35813 382 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 KCNJ5P48544 419 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 ELLP55199 621 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 RPS16P62249 146 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 SLFN5Q08AF3 891 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC142Q17RM4 750 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 GEN1Q17RS7 908 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-207ENST00000418674 MICU3Q86XE3 530 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 LIX1LQ8IVB5 337 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 VOPP1Q96AW1 172 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 AIFM2Q9BRQ8 373 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 CRB3Q9BUF7 120 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 BRIP1Q9BX63 1249 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 PPCSQ9HAB8 311 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 HSFX1Q9UBD0 423 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 CDC23Q9UJX2 597 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 SLC45A2Q9UMX9 530 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 LRCH1Q9Y2L9 728 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 COX11Q9Y6N1 276 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 A0A087WWL8 130 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF785A8K8V0 405 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 TBC1D4O60343 1298 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 UNC5CO95185 931 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 SLC13A2Q13183 592 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 CTBP1Q13363 440 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 PMS2P11Q13670 270 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 LNX2Q8N448 690 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 CCDC33Q8N5R6 958 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 AOPEPQ8N6M6 819 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 ATP11CQ8NB49 1132 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 ACTRT2Q8TDY3 377 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 SSH3Q8TE77 659 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 SCAMP4Q969E2 229 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 HEPHQ9BQS7 1158 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 KCTD5Q9NXV2 234 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 CDYLQ9Y232 598 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-207ENST00000418674 NEU2Q9Y3R4 380 aa3.5□□□□□ -1.85
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