RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 PARP14Q460N5 1801 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 PEX11AO75192 247 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 NLRP9Q7RTR0 991 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 LRRC6Q86X45 466 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC125Q86Z20 511 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 WRNIP1Q96S55 665 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 LRCH4O75427 683 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 FAM155BO75949 473 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 KRT19P08727 400 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 BACE1P56817 501 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 SESN3P58005 492 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 RTP1P59025 263 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 LMNB2Q03252 620 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM192Q8IY95 271 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 UBR7Q8N806 425 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 TTC25Q96NG3 672 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 PLCD4Q9BRC7 762 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 MGAMO43451 1857 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 NFASCO94856 1347 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 KCNA3P22001 575 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 ARL2P36404 184 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 ABL2P42684 1182 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 NAMPTP43490 491 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC142Q17RM4 750 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 FAXCQ5TGI0 409 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 PCYT2Q99447 389 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 DONSONQ9NYP3 566 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 HACL1Q9UJ83 578 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 A0A1B0GUA9 196 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 MAGEB2O15479 319 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 STAM2O75886 525 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 CALB1P05937 261 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 YY1P25490 414 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 RAD23BP54727 409 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 NR1H3Q13133 447 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 TAF11Q15544 211 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 EFHC2Q5JST6 749 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 DLK2Q6UY11 383 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 RFX6Q8HWS3 928 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 MIPEPQ99797 713 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 CALN1Q9BXU9 219 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 LCTP09848 1927 aa14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 RLFQ13129 1914 aa14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 B4GALT5O43286 388 aa14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 NEBLO76041 1014 aa14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 CIAPIN1Q6FI81 312 aa14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 TDRPQ86YL5 185 aa14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 MTMR14Q8NCE2 650 aa14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 RSAD2Q8WXG1 361 aa14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 TTC17Q96AE7 1141 aa14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 CPXM1Q96SM3 734 aa14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.77□□□□□ -0.04
CNGA3-204ENST00000409937 ITGAVP06756 1048 aa14.77□□□□□ -0.05
CNGA3-204ENST00000409937 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
CNGA3-204ENST00000409937 TRPC3Q13507 836 aa14.77□□□□□ -0.05
CNGA3-204ENST00000409937 ZNF699Q32M78 642 aa14.77□□□□□ -0.05
CNGA3-204ENST00000409937 TTC7BQ86TV6 843 aa14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms