RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384479.1

RNU6-790P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 790, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-790P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 KIAA1586Q9HCI6 787 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 GABRQQ9UN88 632 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 A0A1W2PPL8 197 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 WIPF3A6NGB9 483 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 VPS4BO75351 444 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 TTLL1O95922 423 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZBED1O96006 694 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 RHOP08100 348 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 CHRM3P20309 590 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 GPD1P21695 349 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 DRD4P21917 467 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 PTH2RP49190 550 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 CACNB3P54284 484 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 UCP3P55916 312 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 SATB1Q01826 763 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 TBCCQ15814 346 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 SWSAP1Q6NVH7 229 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 MTHFD1LQ6UB35 978 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 LAYNQ6UX15 382 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF783Q6ZMS7 281 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 OR6B3Q8NGW1 331 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 JDP2Q8WYK2 163 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 RSPRY1Q96DX4 576 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 TMX2Q9Y320 296 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 AOX1Q06278 1338 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 GOLGA6CA6NDK9 693 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 GOLGA6BA6NDN3 693 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 LRRC3CA6NJW4 275 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 BTN3A1O00481 513 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 PPM1DO15297 605 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 MARCH6O60337 910 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 GOLGA6DP0CG33 693 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 JUPP14923 745 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 RPL17P18621 184 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 PDE6CP51160 858 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 DGKEP52429 567 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 PROK1P58294 105 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 LILRA4P59901 499 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 RAB32Q13637 225 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 E2F2Q14209 437 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 LRRC41Q15345 812 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 APOA5Q6Q788 366 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 MAVSQ7Z434 540 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF804AQ7Z570 1209 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 MICU3Q86XE3 530 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 FBXO41Q8TF61 875 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 HASPINQ8TF76 798 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 SOCS4Q8WXH5 440 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 MAML1Q92585 1016 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 MSLNLQ96KJ4 702 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 HAPLN3Q96S86 360 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 FAM204AQ9H8W3 233 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARMT1Q9H993 441 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARHGEF3Q9NR81 526 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 CPA4Q9UI42 421 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 ADAM21Q9UKJ8 722 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 WNT6Q9Y6F9 365 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 TRIM43BA6NCK2 446 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 MYO1CO00159 1063 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 MASP2O00187 686 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 TBX3O15119 743 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 CCP110O43303 1012 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 CSF1RP07333 972 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 NR2F6P10588 404 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 KCNA3P22001 575 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 CCT8P50990 548 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 FOXF2Q12947 444 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 MYO1EQ12965 1108 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 CTBP1Q13363 440 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 MLC1Q15049 377 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 MGAT5BQ3V5L5 792 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 FAM153CQ494X1 144 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC44A4Q53GD3 710 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARHGAP40Q5TG30 622 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-790P-201ENST00000384479 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms