RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLEC4DQ8WXI8 215 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C17orf77Q96MU5 243 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OSBPL2Q9H1P3 480 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR10A5Q9H207 317 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC39A2Q9NP94 309 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MYNNQ9NPC7 610 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SERTAD4Q9NUC0 356 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KLHL11Q9NVR0 708 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GPRC5DQ9NZD1 345 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBXL17Q9UF56 701 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DENND2AQ9ULE3 1009 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MUC21A0A140T8X8 626 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WDR27A2RRH5 827 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 B5MCH6 92 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HAT1O14929 419 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 XPNPEP2O43895 674 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LGR5O75473 907 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ITGA10O75578 1167 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GPANK1O95872 356 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TUBBP07437 444 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CHRM2P08172 466 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HOXB7P09629 217 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NR1D1P20393 614 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIR2DL3P43628 341 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PCYT1AP49585 367 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TUBB4BP68371 445 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ITIH3Q06033 890 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ST3GAL2Q16842 350 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MUC21Q5SSG8 566 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRR22Q8IZ63 422 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IL17RAQ96F46 866 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EXOC2Q96KP1 924 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ART5Q96L15 291 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC6A20Q9NP91 592 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FZD3Q9NPG1 666 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MRVI1Q9Y6F6 885 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZANQ9Y493 2812 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NACAE9PAV3 2078 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MYO10Q9HD67 2058 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR6C75A6NL08 312 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MCIDASD6RGH6 385 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CEP104O60308 925 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NDUFB8O95169 186 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ITGA2BP08514 1039 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ITIH1P19827 911 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DGKAP23743 735 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PMELP40967 661 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C16orf72Q14CZ0 275 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PLCB4Q15147 1175 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARHGAP17Q68EM7 881 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGFL2Q6UWQ7 119 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRIM72Q6ZMU5 477 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USP53Q70EK8 1073 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC26A9Q7LBE3 791 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 Q8N9L7 120 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZFP28Q8NHY6 868 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CD101Q93033 1021 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TAAR8Q969N4 342 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GDF15Q99988 308 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WNT8AQ9H1J5 351 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CATSPERZQ9NTU4 200 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 INTS13Q9NVM9 706 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRODH2Q9UF12 536 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RPTORQ8N122 1335 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TPRP12270 2363 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1008P-201ENST00000384160 A0A087WZG4 1122 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1008P-201ENST00000384160 A0A0J9YXV3 536 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF878C9JN71 531 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM232C9JQI7 657 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ALAS1P13196 640 aa-1.35□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms