RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF8O76064 485 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NDUFB8O95169 186 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRT6AP02538 564 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRT6BP04259 564 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GAAP10253 952 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP3CBP16298 524 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GARTP22102 1010 aa-0.53□□□□□ -2.49
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRT6CP48668 564 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ABHD15Q6UXT9 468 aa-0.53□□□□□ -2.49
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 OAFQ86UD1 273 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TICAM1Q8IUC6 712 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DEPTORQ8TB45 409 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DPF2Q92785 391 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM125Q96AQ2 219 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC140Q96MF4 163 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BCL11AQ9H165 835 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PDZD7Q9H5P4 517 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NR2E3Q9Y5X4 410 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CACNA1HO95180 2353 aa-0.53□□□□□ -2.49
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZMYM3Q14202 1370 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BAHCC1Q9P281 2608 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NXPH3O95157 252 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FCGR1AP12314 374 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AMD1P17707 334 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLRN1P58418 232 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPS7P62081 194 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PWP1Q13610 501 aa-0.54□□□□□ -2.5
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRSS53Q2L4Q9 553 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCID2Q5JVF3 399 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC25A30Q5SVS4 291 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAAP20Q6NZ36 180 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 METTL7BQ6UX53 244 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EXOC3L1Q86VI1 746 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 Q8NA96 180 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRRC8CQ8TDW0 803 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SH3TC2Q8TF17 1288 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MAP4K1Q92918 833 aa-0.54□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MRGPRX3Q96LB0 322 aa-0.54□□□□□ -2.5
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 APEX2Q9UBZ4 518 aa-0.54□□□□□ -2.5
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-0.54□□□□□ -2.5
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MSCO60682 206 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PRAMEF10O60809 474 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP-0.55□□□□□ -2.5
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF212Q495C1 297 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ASPHD2Q6ICH7 369 aa-0.55□□□□□ -2.5
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP-0.55□□□□□ -2.5
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RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC15A3Q8IY34 581 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PIK3C3Q8NEB9 887 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM76AQ8TAV0 307 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BTN2A2Q8WVV5 523 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PNKPQ96T60 521 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TUBA1CQ9BQE3 449 aa-0.55□□□□□ -2.5
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DNAJB11Q9UBS4 358 aa-0.55□□□□□ -2.5
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