RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 OAZ2O95190 189 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 PTPN14Q15678 1187 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 WDTC1Q8N5D0 677 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF653Q96CK0 615 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 ADAM22Q9P0K1 906 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 C2CD6Q53TS8 623 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 TAS1R1Q7RTX1 841 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 TTC30AQ86WT1 665 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 MCOLN2Q8IZK6 566 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 TMEM209Q96SK2 561 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 TTPALQ9BTX7 342 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 SPG21Q9NZD8 308 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 CLDN5O00501 218 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 KIF5CO60282 957 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 GPD2P43304 727 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 GPC5P78333 572 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 CTXN3Q4LDR2 81 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 RTP2Q5QGT7 225 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF280DQ6N043 979 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 MON1BQ7L1V2 547 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 ERICH1Q86X53 443 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 FUKQ8N0W3 1084 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD52Q8NB46 1076 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 ARHGEF26Q96DR7 871 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM11Q96F44 468 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 PCED1BQ96HM7 432 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 NOX5Q96PH1 765 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 MYO1AQ9UBC5 1043 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 CYTH4Q9UIA0 394 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 MYOGP15173 224 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 MMP8P22894 467 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 PPM1AP35813 382 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 BCAT1P54687 386 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 USP41Q3LFD5 358 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 NYAP1Q6ZVC0 841 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 MSANTD4Q8NCY6 345 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 MYLPFQ96A32 169 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 B3GNT5Q9BYG0 378 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 SYNCQ9H7C4 482 aa23.14■■□□□ 1.3
HOXA4-201ENST00000360046 NCANO14594 1321 aa23.14■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 BUB1O43683 1085 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 BST2Q10589 180 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 PDCLQ13371 301 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 PKDCCQ504Y2 493 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 LIN9Q5TKA1 542 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 ST7Q9NRC1 585 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 SALL4Q9UJQ4 1053 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 BTNL10A8MVZ5 291 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 MOCS3O95396 460 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 CALB1P05937 261 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 OR4Q2P0C623 313 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 MYBL1P10243 752 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 SLC8A3P57103 927 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 GNG11P61952 73 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 PLCB3Q01970 1234 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 PDE4CQ08493 712 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 FAM171BQ6P995 826 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 FAM35AQ86V20 835 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 RFFLQ8WZ73 363 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 VCPIP1Q96JH7 1222 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 CPXM1Q96SM3 734 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 KRT82Q9NSB4 513 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 H7C4K7 107 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 EFEMP2O95967 443 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 FAM200BP0CF97 657 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 SETSIPP0DME0 302 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 RRM1P23921 792 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 PTPN20Q4JDL3 420 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 SLC39A12Q504Y0 691 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 PAQR9Q6ZVX9 377 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 LRRTM3Q86VH5 581 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 SLC35G2Q8TBE7 412 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 PKMYT1Q99640 499 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXA4-201ENST00000360046 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms