RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 NEMP1O14524 444 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 OLR1P78380 273 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 NIM1KQ8IY84 436 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 EID3Q8N140 333 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SPATA18Q8TC71 538 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ANKS1AQ92625 1134 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 BORCS5Q969J3 196 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 RNFT2Q96EX2 444 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 CHID1Q9BWS9 393 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 HAO1Q9UJM8 370 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SNAPC5O75971 98 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 HIST1H2ADP20671 130 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 YWHABP31946 246 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SEC24CP53992 1094 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 EXOC3L1Q86VI1 746 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 HIST1H2AJQ99878 128 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 H2AFJQ9BTM1 129 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 CYP39A1Q9NYL5 469 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 FAM92AA1XBS5 289 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 HEATR9A2RTY3 570 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 PDHBP11177 359 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 CCDC162PA2VCL2 907 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 NR1D2Q14995 579 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 LLGL1Q15334 1064 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 DLGAP5Q15398 846 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 CYP51A1Q16850 503 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 PACS2Q86VP3 889 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SH3BP4Q9P0V3 963 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 DMTF1Q9Y222 760 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MYBPC2Q14324 1141 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF235Q14590 738 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 NDUFAF6Q330K2 333 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 AADATQ8N5Z0 425 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 CYLDQ9NQC7 956 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.54□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SUPT3HB4E1H0 165 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 RAD51Q06609 339 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 HEY2Q9UBP5 337 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 HUS1O60921 280 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MYL12AP19105 171 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 BTDP43251 543 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ITGA8P53708 1063 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 CCSER1Q9C0I3 900 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 M0QYV0 167 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 RIMBP2O15034 1052 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SOAT2O75908 522 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ATP6V1C1P21283 382 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 GMFBP60983 142 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MZT2AQ6P582 158 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 KRT78Q8N1N4 520 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MDH1BQ5I0G3 518 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 UNC45BQ8IWX7 931 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 LRRC34Q8IZ02 419 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 PCIF1Q9H4Z3 704 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ZBTB5O15062 677 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 KCTD2Q14681 263 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 PDPRQ8NCN5 879 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 HES6Q96HZ4 224 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ERGIC2Q96RQ1 377 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 THAP1Q9NVV9 213 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 CAPZA2P47755 286 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MAPKAPK2P49137 400 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 CAMK1DQ8IU85 385 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 AGR3Q8TD06 166 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 PEX1O43933 1283 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 KCNMA1Q12791 1236 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 BROXQ5VW32 411 aa8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms