RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 LCMT1Q9UIC8 334 aa18.88■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 THSD7BQ9C0I4 1608 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 A8MXQ7 604 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 TULP2O00295 520 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 LMO2P25791 158 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 RGS7P49802 495 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 TAF6P49848 677 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 RPAINQ86UA6 219 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 UNC93AQ86WB7 457 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 ATG4AQ8WYN0 398 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP18.87■□□□□ 0.613e-8■■■■■ 63.7
ACTB-201ENST00000331789 LPPQ93052 612 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 OSBPL8Q9BZF1 889 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 CHST7Q9NS84 486 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 GDAP2Q9NXN4 497 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 SNX24Q9Y343 169 aa18.87■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA6BA6NDN3 693 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 FLT3P36888 993 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 PNPLA4P41247 253 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 TTC30AQ86WT1 665 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 RCOR2Q8IZ40 523 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 CHST12Q9NRB3 414 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 CACNG4Q9UBN1 327 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 RASAL2Q9UJF2 1139 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 PTPN22Q9Y2R2 807 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 E5RJQ4 531 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 KRT1P04264 644 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 FNTAP49354 379 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 LILRA4P59901 499 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 STILQ15468 1287 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 PKDCCQ504Y2 493 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 LRRC38Q5VT99 294 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 OR6B2Q6IFH4 312 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 PMF1Q6P1K2 205 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 MREGQ8N565 214 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 MAIP1Q8WWC4 291 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 SLITRK1Q96PX8 696 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 DCLK3Q9C098 648 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 MIOSQ9NXC5 875 aa18.86■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 HOXD10P28358 340 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 LRPAP1P30533 357 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 CD52P31358 61 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 GYS2P54840 703 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 ITGA7Q13683 1181 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 SV2CQ496J9 727 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 HSP90B2PQ58FF3 399 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 MFSD7Q6UXD7 560 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 LIMS2Q7Z4I7 341 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 GSTCDQ8NEC7 633 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 APPL2Q8NEU8 664 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 GAD1Q99259 594 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 SNX25Q9H3E2 840 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 CREBZFQ9NS37 354 aa18.85■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 GPR182O15218 404 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 GHRP10912 638 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 KRT10P13645 584 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 MLH1P40692 756 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 ADCY2Q08462 1091 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 ALS2CLQ60I27 953 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 FAM71BQ8TC56 605 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 RAET1EQ8TD07 263 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 FNIP1Q8TF40 1166 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 PIK3R5Q8WYR1 880 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 RAPGEF5Q92565 580 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 RUNDC3BQ96NL0 473 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 FAM118BQ9BPY3 351 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 ZWILCHQ9H900 591 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 MED4Q9NPJ6 270 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 PADI3Q9ULW8 664 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 FAN1Q9Y2M0 1017 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 PODXLO00592 558 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 MGEA5O60502 916 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 HSF2BPO75031 334 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 LRCH4O75427 683 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 GABBR2O75899 941 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 CCDC130P13994 396 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 RPL21P46778 160 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 ACLYP53396 1101 aa18.84■□□□□ 0.61
ACTB-201ENST00000331789 KAZNQ674X7 775 aa18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms