RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 ACADSP16219 412 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 BGNP21810 368 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 RPL22P35268 128 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 RFC5P40937 340 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 MXRA7P84157 204 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 TTC17Q96AE7 1141 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 FAM111AQ96PZ2 611 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 TSSK1BQ9BXA7 367 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.79■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 E5RJQ4 531 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 GYG2O15488 501 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 IL1R2P27930 398 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 UNC45BQ8IWX7 931 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 FBXO41Q8TF61 875 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 RIPK3Q9Y572 518 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 CCDC22O60826 627 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 ARFIP2P53365 341 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 PRKCEQ02156 737 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 DLGAP5Q15398 846 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 RNF220Q5VTB9 566 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 FBXO27Q8NI29 283 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 FAM136AQ96C01 138 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 TRIM55Q9BYV6 548 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.78■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 CAPN9O14815 690 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 CST8O60676 142 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 TBX10O75333 385 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 ZBTB16Q05516 673 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 MCL1Q07820 350 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 PALM2Q8IXS6 379 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 CYP26B1Q9NR63 512 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 TAS2R1Q9NYW7 299 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 LPXNO60711 386 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 FAM155BO75949 473 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 ARL4CP56559 192 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 KLC1Q07866 573 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 NCOA4Q13772 614 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 SKA1Q96BD8 255 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 NSL1Q96IY1 281 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 FBXO40Q9UH90 709 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 WASF2Q9Y6W5 498 aa22.77■■□□□ 1.24
ELL3-201ENST00000319359 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 RGS20O76081 388 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 SP100P23497 879 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 RCN2Q14257 317 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 TAF5Q15542 800 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 TFAP2BQ92481 460 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 DGAT1O75907 488 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 NEFHP12036 1026 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 VHLP40337 213 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 INHBEP58166 350 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 FAAP100Q0VG06 881 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 RASA2Q15283 850 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 JOSD2Q8TAC2 188 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 STOML1Q9UBI4 398 aa22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 UTRNP46939 3433 aa22.75■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.75■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 SMIM24O75264 130 aa22.75■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 AVILO75366 819 aa22.75■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 DLDP09622 509 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 PHBP35232 272 aa22.75■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 TNFSF9P41273 254 aa22.75■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 BASP1P80723 227 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 VPS52Q8N1B4 723 aa22.75■■□□□ 1.23
ELL3-201ENST00000319359 MCUR1Q96AQ8 359 aa22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms